Description du projet
Des lipides membranaires dans le processus d’autophagie chez les plantes
L’autophagie est un mécanisme naturel par lequel les cellules éliminent leurs propres composants dysfonctionnels par dégradation et recyclage. Le processus nécessite la formation de vésicules appelées autophagosomes, qui engloutissent les composants intracellulaires et les livrent à une vacuole lytique. La formation des autophagosomes est dirigée par une machinerie dédiée de protéines et de lipides. Ce projet financé par l’UE étudie les mécanismes fondamentaux moins étudiés de la contribution des lipides à l’ensemble de ce processus dans les cellules végétales. La recherche se concentrera sur les questions fondamentales explorant comment la nature, la dynamique et l’hétérogénéité latérale des lipides déterminent la structure du phagophore, sa composition et ses fonctions protéiques, en utilisant une combinaison d’approches protéomique/bioinformatique, de lipidomique et d’imagerie 3D haute résolution.
Objectif
Autophagy is an intracellular catabolic process critical to eukaryotic life and indispensable for plant survival to drought, nutrient scarcity or pathogen attacks. Autophagy relies on the formation of specialized vesicles called autophagosomes (AP) which engulf and deliver cell components to the lytic vacuole. AP biogenesis is carried out by a group of dedicated proteins (named ATG) and hinges on intense remodelling events and on the remarkable capacity of an initial membrane, the phagophore, to assemble de novo, shape like a cup, expand while maintaining structure and function and re-shape to a complete vesicle. To date the molecular mechanisms underlying these events remain elusive. Research has focused on the role of autophagy proteins but, despite AP biogenesis being a membrane-based process, the fundamental contributions of lipids to AP membrane formation, identity and activities have been largely unexplored; in other words, when it comes to AP formation we are only looking at half of the picture.
I propose to address the fundamental question of how APs form and shape from a novel angle: by exploring how lipids’ nature, dynamics and lateral heterogeneity instruct the phagophore structure, its protein composition and its functions. The project builds on our recent results and expands on strategies that we have developed, integrating proteomic/bioinformatic approaches, lipidomics and high-resolution 3D imaging. We will tackle 3 complementary objectives: 1) Reveal the dynamic lipid signature of the phagophore, 2) Elucidate the implication of lipids nature and repartition in the phagophore ultrastructure, 3) Decrypt the molecular mechanisms by which lipids interplay with ATG proteins to control autophagy activity and plant physiology. Overall the project will articulate an integrated vision of the molecular processes controlling autophagy and provide fundamental knowledge in our understanding of plant adaptive programs.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- sciences naturellessciences biologiquesbiochimiebiomoléculeprotéines
- sciences naturellessciences biologiquesbiochimiebiomoléculelipides
- sciences médicales et de la santémédecine fondamentalephysiologie
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Mots‑clés
Programme(s)
Thème(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2019-STG
Voir d’autres projets de cet appelRégime de financement
ERC-STG - Starting GrantInstitution d’accueil
75794 Paris
France