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Contenu archivé le 2024-05-29

Structural studies of the RNA polymerase II transcription machinery: mechanism of start site selection

Objectif

The current application concerns the mechanisms of transcription initiation in eukaryotic cells. The postdoc-project will be carried out in Prof. Roger D. Kornberg's laboratory at Stanford University, California.

THE SPECIFIC AIM of the project is a molecular understanding of how RNA polymerase II (RNAP II) together with the general transcription factors (GTFs) can recognize promoter DNA and initiate RNA synthesis at a specific genomic location.

Reports have shown that RNAP II and TFIIB are solely responsible for this process, but the underlying mechanism is still not known. Recently the structure of a RNAP II/TFIIB cocrystal has been solved in budding yeast. The transcription start site differs however in this yeast compared to fission yeast and most other eukaryotes including human so a general model for the selection process could not be elucidated from this structure.

OUR MAIN OBJECTIVES are to do structural analysis of a RNAP II/TFIIB complex in fission yeast with X-ray crystallography and compare it to t he budding yeast structure. We will complement the structural information with mutational analysis of TFIIB in a pure in vitro transcription system derived from fission yeast developed by me as a Ph.D. student.

THE OVERALL GOAL with the project is to generate a general molecular model for the transcription start site selection process.

My stay will lead to the acquirement of new technological knowledge such as structural analysis of multi-protein complexes with X-ray crystallography that I believe will be a vibrant scientific field in the future.

I will also be able to develop a scientific network that will be useful for my future career as a scientist, as well as the European community, after my return to Sweden.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2002-MOBILITY-6
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

OIF - Marie Curie actions-Outgoing International Fellowships

Coordinateur

KAROLINSKA INSTITUTET
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Participants (1)

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