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Contenuto archiviato il 2024-05-29

Structural studies of the RNA polymerase II transcription machinery: mechanism of start site selection

Obiettivo

The current application concerns the mechanisms of transcription initiation in eukaryotic cells. The postdoc-project will be carried out in Prof. Roger D. Kornberg's laboratory at Stanford University, California.

THE SPECIFIC AIM of the project is a molecular understanding of how RNA polymerase II (RNAP II) together with the general transcription factors (GTFs) can recognize promoter DNA and initiate RNA synthesis at a specific genomic location.

Reports have shown that RNAP II and TFIIB are solely responsible for this process, but the underlying mechanism is still not known. Recently the structure of a RNAP II/TFIIB cocrystal has been solved in budding yeast. The transcription start site differs however in this yeast compared to fission yeast and most other eukaryotes including human so a general model for the selection process could not be elucidated from this structure.

OUR MAIN OBJECTIVES are to do structural analysis of a RNAP II/TFIIB complex in fission yeast with X-ray crystallography and compare it to t he budding yeast structure. We will complement the structural information with mutational analysis of TFIIB in a pure in vitro transcription system derived from fission yeast developed by me as a Ph.D. student.

THE OVERALL GOAL with the project is to generate a general molecular model for the transcription start site selection process.

My stay will lead to the acquirement of new technological knowledge such as structural analysis of multi-protein complexes with X-ray crystallography that I believe will be a vibrant scientific field in the future.

I will also be able to develop a scientific network that will be useful for my future career as a scientist, as well as the European community, after my return to Sweden.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2002-MOBILITY-6
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

OIF - Marie Curie actions-Outgoing International Fellowships

Coordinatore

KAROLINSKA INSTITUTET
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (1)

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