European School of Network Neuroscience

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Livrables

Web-based communication platform

Relates to Task 53

Core skills curriculum

Relates to Task 54

Open source network science curriculum and tutorial

Relates to Task 6.7.

euSNN web portal

Relates to Task 61

Publications

A developmental increase of inhibition promotes the emergence of hippocampal ripples

Auteurs: Irina Pochinok, Tristan M. Stöber, Jochen Triesch, Mattia Chini, Ileana L. Hanganu-Opatz
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-44983-z

Strength-dependent perturbation of whole-brain model working in different regimes reveals the role of fluctuations in brain dynamics

Auteurs: Yonatan Sanz Perl, Anira Escrichs, Enzo Tagliazucchi, Morten L. Kringelbach, Gustavo Deco
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 18, 2023, Page(s) e1010662, ISSN 1553-7358
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010662

An increase of inhibition drives the developmental decorrelation of neural activity

Auteurs: Mattia Chini, Thomas Pfeffer, Ileana Hanganu-Opatz
Publié dans: eLife, Numéro 11, 2023, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.78811

Dynamical models to evaluate structure–function relationships in network neuroscience

Auteurs: Andrea I. Luppi, Joana Cabral, Rodrigo Cofre, Alain Destexhe, Gustavo Deco, Morten L. Kringelbach
Publié dans: Nature Reviews Neuroscience, Numéro 23, 2022, Page(s) 767-768, ISSN 1471-003X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41583-022-00646-w

Cingulum and Uncinate Fasciculus Microstructural Abnormalities in Parkinson’s Disease: A Systematic Review of Diffusion Tensor Imaging Studies

Auteurs: Fatemeh Rashidi, Mohammad Hossein Khanmirzaei, Farbod Hosseinzadeh, Zahra Kolahchi, Niloofar Jafarimehrabady, Bardia Moghisseh, Mohammad Hadi Aarabi
Publié dans: Biology, Numéro 12, 2023, Page(s) 475, ISSN 2079-7737
Éditeur: MDPI Open Access Journals
DOI: 10.3390/biology12030475

Calcium Imaging and Electrophysiology of hippocampal Activity under Anesthesia and natural Sleep in Mice

Auteurs: Andrey Formozov, Mattia Chini, Alexander Dieter, Wei Yang, Jastyn A. Pöpplau, Ileana L. Hanganu-Opatz, J. Simon Wiegert
Publié dans: Scientific Data, Numéro 9, 2022, ISSN 2052-4463
Éditeur: Nature
DOI: 10.1038/s41597-022-01244-2

Edge-centric analysis of stroke patients: An alternative approach for biomarkers of lesion recovery

Auteurs: Sebastian Idesis, Joshua Faskowitz, Richard F. Betzel, Maurizio Corbetta, Olaf Sporns, Gustavo Deco
Publié dans: NeuroImage: Clinical, Numéro 35, 2024, Page(s) 103055, ISSN 2213-1582
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nicl.2022.103055

Role of homeostatic plasticity in critical brain dynamics following focal stroke lesions

Auteurs: Rodrigo P. Rocha, Marco Zorzi, Maurizio Corbetta
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 14, 2024, Page(s) 31631, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-80196-6

Effects of classic psychedelic drugs on turbulent signatures in brain dynamics

Auteurs: Josephine Cruzat, Yonatan Sanz Perl, Anira Escrichs, Jakub Vohryzek, Christopher Timmermann, Leor Roseman, Andrea I. Luppi, Agustin Ibañez, David Nutt, Robin Carhart-Harris, Enzo Tagliazucchi, Gustavo Deco, Morten L. Kringelbach
Publié dans: Network Neuroscience, Numéro 6, 2022, Page(s) 1104-1124, ISSN 2472-1751
Éditeur: MIT Press Direct
DOI: 10.1162/netn_a_00250

Smaller Cerebellar Lobule VIIb is Associated with Tremor Severity in Parkinson’s Disease

Auteurs: Fatemeh Sadeghi, Monika Pötter-Nerger, Kai Grimm, Christian Gerloff, Robert Schulz, Simone Zittel
Publié dans: The Cerebellum, Numéro 23, 2024, Page(s) 355-362, ISSN 1473-4230
Éditeur: Springer Link
DOI: 10.1007/s12311-023-01532-6

Functional and structural lesion network mapping in neurological and psychiatric disorders: a systematic review

Auteurs: Fardin Nabizadeh, Mohammad Hadi Aarabi
Publié dans: Frontiers in Neurology, Numéro 14, 2023, ISSN 1664-2295
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fneur.2023.1100067

Dynamic sensitivity analysis: Defining personalised strategies to drive brain state transitions via whole brain modelling

Auteurs: Jakub Vohryzek, Joana Cabral, Francesca Castaldo, Yonatan Sanz-Perl, Louis-David Lord, Henrique M. Fernandes, Vladimir Litvak, Morten L. Kringelbach, Gustavo Deco
Publié dans: Computational and Structural Biotechnology Journal, Numéro 21, 2024, Page(s) 335-345, ISSN 2001-0370
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2022.11.060

White Matter Microstructure Associated with the Antidepressant Effects of Deep Brain Stimulation in Treatment-Resistant Depression: A Review of Diffusion Tensor Imaging Studies

Auteurs: Giulia Cattarinussi, Hossein Sanjari Moghaddam, Mohammad Hadi Aarabi, Letizia Squarcina, Fabio Sambataro, Paolo Brambilla, Giuseppe Delvecchio
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 23, 2024, Page(s) 15379, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms232315379

Rare long-range cortical connections enhance human information processing

Auteurs: Gustavo Deco, Yonathan Sanz Perl, Peter Vuust, Enzo Tagliazucchi, Henry Kennedy, Morten L. Kringelbach
Publié dans: Current Biology, Numéro 31, 2023, Page(s) 4436-4448.e5, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2021.07.064

The relationship between frequency content and representational dynamics in the decoding of neurophysiological data

Auteurs: Cameron Higgins, Mats W.J. van Es, Andrew J. Quinn, Diego Vidaurre, Mark W. Woolrich
Publié dans: NeuroImage, Numéro 260, 2024, Page(s) 119462, ISSN 1053-8119
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2022.119462

Interdisciplinary and Collaborative Training in Neuroscience: Insights from the Human Brain Project Education Programme

Auteurs: Alice Geminiani, Judith Kathrein, Alper Yegenoglu, Franziska Vogel, Marcelo Armendariz, Ziv Ben-Zion, Petrut Antoniu Bogdan, Joana Covelo, Marissa Diaz Pier, Karin Grasenick, Vitali Karasenko, Wouter Klijn, Tina Kokan, Carmen Alina Lupascu, Anna Lührs, Tara Mahfoud, Taylan Özden, Jens Egholm Pedersen, Luca Peres, Ingrid Reiten, Nikola Simidjievski, Inga Ulnicane, Michiel van der Vlag, Lyuba Zehl
Publié dans: Neuroinformatics, Numéro 22, 2024, Page(s) 657-678, ISSN 1559-0089
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1007/s12021-024-09682-6

Recording physiological and pathological cortical activity and exogenous electric fields using graphene microtransistor arrays <i>in vitro</i>

Auteurs: Nathalia Cancino-Fuentes, Arnau Manasanch, Joana Covelo, Alex Suarez-Perez, Enrique Fernandez, Stratis Matsoukis, Christoph Guger, Xavi Illa, Anton Guimerà-Brunet, Maria V. Sanchez-Vives
Publié dans: Nanoscale, Numéro 16, 2024, Page(s) 664-677, ISSN 2040-3364
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3nr03842d

Chronic full-band recordings with graphene microtransistors as neural interfaces for discrimination of brain states

Auteurs: A. Camassa, A. Barbero-Castillo, M. Bosch, M. Dasilva, E. Masvidal-Codina, R. Villa, A. Guimerà-Brunet, M. V. Sanchez-Vives
Publié dans: Nanoscale Horizons, Numéro 9, 2024, Page(s) 589-597, ISSN 2055-6756
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3nh00440f

Metastable oscillatory modes emerge from synchronization in the brain spacetime connectome

Auteurs: Joana Cabral, Francesca Castaldo, Jakub Vohryzek, Vladimir Litvak, Christian Bick, Renaud Lambiotte, Karl Friston, Morten L. Kringelbach, Gustavo Deco
Publié dans: Communications Physics, Numéro 5, 2023, ISSN 2399-3650
Éditeur: Nature
DOI: 10.1038/s42005-022-00950-y

Olfactory bulb activity shapes the development of entorhinal-hippocampal coupling and associated cognitive abilities

Auteurs: Yu-Nan Chen, Johanna K. Kostka, Sebastian H. Bitzenhofer, Ileana L. Hanganu-Opatz
Publié dans: Current Biology, Numéro 33, 2024, Page(s) 4353-4366.e5, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2023.08.072

The human language effective connectome

Auteurs: Edmund T. Rolls, Gustavo Deco, Chu-Chung Huang, Jianfeng Feng
Publié dans: NeuroImage, Numéro 258, 2024, Page(s) 119352, ISSN 1053-8119
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2022.119352

Multiscale Effects of Excitatory-Inhibitory Homeostasis in Lesioned Cortical Networks: A Computational Study

Auteurs: Francisco Páscoa dos Santos, Jakub Vohryzek, Paul F.M.J. Verschure
Publié dans: PLoS Computational Biology, Numéro 19(7):e1011279, 2024, ISSN 1553-7358
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1101/2022.11.23.517696

Functional hierarchies in brain dynamics characterized by signal reversibility in ferret cortex

Auteurs: Sebastian Idesis, Sebastián Geli, Joshua Faskowitz, Jakub Vohryzek, Yonatan Sanz Perl, Florian Pieper, Edgar Galindo-Leon, Andreas K. Engel, Gustavo Deco
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 20, 2024, Page(s) e1011818, ISSN 1553-7358
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1011818

Developmental increase of inhibition drives decorrelation of neural activity

Auteurs: Mattia Chini, Thomas Pfeffer, Ileana L. Hanganu-Opatz
Publié dans: eLife, Numéro 11, 2022, Page(s) e78811, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2021.07.06.451299

Microstructural alterations of cerebellar peduncles in multiple sclerosis: a diffusion tensor imaging study

Auteurs: Homa Seyedmirzaei, Alireza Soltani Khaboushan, Amirhussein Abdolalizadeh, Mohammad Hadi Aarabi
Publié dans: Acta Neurologica Belgica, 2024, ISSN 0300-9009
Éditeur: Acta Medica Belgica
DOI: 10.1007/s13760-024-02675-x

Multi-modal and multi-model interrogation of large-scale functional brain networks

Auteurs: Francesca Castaldo, Francisco Páscoa dos Santos, Ryan C Timms, Joana Cabral, Jakub Vohryzek, Gustavo Deco, Mark Woolrich, Karl Friston, Paul Verschure, Vladimir Litvak
Publié dans: NeuroImage, Numéro 277:120236, 2024, ISSN 1053-8119
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1101/2022.12.19.520967

Graph theoretical approach to brain remodeling in multiple sclerosis

Auteurs: AmirHussein Abdolalizadeh, Mohammad Amin Dabbagh Ohadi, Amir Sasan Bayani Ershadi, Mohammad Hadi Aarabi
Publié dans: Network Neuroscience, Numéro 7, 2023, Page(s) 148-159, ISSN 2472-1751
Éditeur: MIT Press Direct
DOI: 10.1162/netn_a_00276

NeuroBus - Architecture for an Ultra-Flexible Neural Interface

Auteurs: Markus Sporer, Ioana-Georgiana Vasilaş, Ahmed Adžemović, Nicolas Graber, Stefan Reich, Calogero Gueli, Max Eickenscheidt, Ilka Diester, Thomas Stieglitz, Maurits Ortmanns
Publié dans: IEEE Transactions on Biomedical Circuits and Systems, Numéro 18, 2024, Page(s) 247-262, ISSN 1932-4545
Éditeur: Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI: 10.1109/tbcas.2024.3354785

A low dimensional embedding of brain dynamics enhances diagnostic accuracy and behavioral prediction in stroke

Auteurs: Sebastian Idesis, Michele Allegra, Jakub Vohryzek, Yonatan Sanz Perl, Joshua Faskowitz, Olaf Sporns, Maurizio Corbetta, Gustavo Deco
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 13, 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-42533-z

Dissecting unsupervised learning through hidden Markov modelling in electrophysiological data

Auteurs: Laura Masaracchia, Felipe Fredes, Mark W. Woolrich, Diego Vidaurre
Publié dans: Journal of Neurophysiology, Numéro 20(2), 2024, Page(s) 364-379, ISSN 0022-3077
Éditeur: American Physiological Society
DOI: 10.1101/2023.01.19.524547

The human posterior cingulate, retrosplenial, and medial parietal cortex effective connectome, and implications for memory and navigation

Auteurs: Edmund T. Rolls, Sylvia Wirth, Gustavo Deco, Chu‐Chung Huang, Jianfeng Feng
Publié dans: Human Brain Mapping, Numéro 44, 2023, Page(s) 629-655, ISSN 1065-9471
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.26089

Excitatory-Inhibitory Homeostasis and Diaschisis: Tying the Local and Global Scales in the Post-stroke Cortex

Auteurs: Francisco Páscoa dos Santos, Paul F. M. J. Verschure
Publié dans: Frontiers in Systems Neuroscience, Numéro 15, 2022, ISSN 1662-5137
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnsys.2021.806544

Mapping Interictal activity in epilepsy using a hidden Markov model: A magnetoencephalography study

Auteurs: Zelekha A. Seedat, Lukas Rier, Lauren E. Gascoyne, Harry Cook, Mark W. Woolrich, Andrew J. Quinn, Timothy P. L. Roberts, Paul L. Furlong, Caren Armstrong, Kelly St. Pier, Karen J. Mullinger, Eric D. Marsh, Matthew J. Brookes, William Gaetz
Publié dans: Human Brain Mapping, Numéro 44, 2023, Page(s) 66-81, ISSN 1065-9471
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.26118

EMD: Empirical Mode Decomposition and Hilbert-Huang Spectral Analyses in Python

Auteurs: Quinn AJ, Lopes-dos-Santos V, Dupret D, Nobre AC, Woolrich MW
Publié dans: Journal of Open Source Software, Numéro 6(59), 2020, Page(s) 2977, ISSN 2475-9066
Éditeur: Journal of Open Source Software
DOI: 10.21105/joss.02977

Assessing the coupling between local neural activity and global connectivity fluctuations: Application to human intracranial electroencephalography during a cognitive task

Auteurs: Manel Vila‐Vidal, Mariam Khawaja, Mar Carreño, Pedro Roldán, Jordi Rumià, Antonio Donaire, Gustavo Deco, Adrià Tauste Campo
Publié dans: Human Brain Mapping, Numéro 44, 2023, Page(s) 1173-1192, ISSN 1065-9471
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.26150

A ventromedial visual cortical ‘Where’ stream to the human hippocampus for spatial scenes revealed with magnetoencephalography

Auteurs: Edmund T. Rolls, Xiaoqian Yan, Gustavo Deco, Yi Zhang, Veikko Jousmaki, Jianfeng Feng
Publié dans: Communications Biology, Numéro 7, 2024, ISSN 2399-3642
Éditeur: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-024-06719-z

Disability and persistent motor deficits are linked to structural crossed cerebellar diaschisis in chronic stroke

Auteurs: Stephanie Guder, Fatemeh Sadeghi, Simone Zittel, Fanny Quandt, Chi‐un Choe, Marlene Bönstrup, Bastian Cheng, Götz Thomalla, Christian Gerloff, Robert Schulz
Publié dans: Human Brain Mapping, Numéro 44, 2023, Page(s) 5336-5345, ISSN 1065-9471
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.26434

Spontaneous Activity Patterns in Human Attention Networks Code for Hand Movements

Auteurs: Lu Zhang, Lorenzo Pini, DoHyun Kim, Gordon L. Shulman, Maurizio Corbetta
Publié dans: The Journal of Neuroscience, Numéro 43, 2023, Page(s) 1976-1986, ISSN 0270-6474
Éditeur: Society for Neuroscience
DOI: 10.1523/jneurosci.1601-22.2023

Imaging the columnar functional organization of human area MT+ to axis-of-motion stimuli using VASO at 7 Tesla

Auteurs: Alessandra Pizzuti, Laurentius (Renzo) Huber, Omer Faruk Gulban, Amaia Benitez-Andonegui, Judith Peters, Rainer Goebel
Publié dans: Cerebral Cortex, Numéro 33, 2023, Page(s) 8693-8711, ISSN 1047-3211
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/cercor/bhad151

Perturbations in dynamical models of whole-brain activity dissociate between the level and stability of consciousness

Auteurs: Yonatan Sanz Perl, Carla Pallavicini, Ignacio Pérez Ipiña, Athena Demertzi, Vincent Bonhomme, Charlotte Martial, Rajanikant Panda, Jitka Annen, Agustín Ibañez, Morten Kringelbach, Gustavo Deco, Helmut Laufs, Jacobo Sitt, Steven Laureys, Enzo Tagliazucchi
Publié dans: PLoS Computational Biology, Numéro 17(7):e1009139, 2024, ISSN 1553-7358
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1101/2020.07.02.185157

Optimizing the montage for cerebellar transcranial alternating current stimulation (tACS): a combined computational and experimental study

Auteurs: Sadeghihassanabadi, F., Misselhorn, J., Gerloff, C., Zittel-Dirks, S
Publié dans: Journal of Neural Engineering, Numéro 19(2), 2022, Page(s) 026060, ISSN 1741-2552
Éditeur: IOP Publishing
DOI: 10.1088/1741-2552/ac676f

Unifying turbulent dynamics framework distinguishes different brain states

Auteurs: Anira Escrichs, Yonatan Sanz Perl, Carme Uribe, Estela Camara, Basak Türker, Nadya Pyatigorskaya, Ane López-González, Carla Pallavicini, Rajanikant Panda, Jitka Annen, Olivia Gosseries, Steven Laureys, Lionel Naccache, Jacobo D. Sitt, Helmut Laufs, Enzo Tagliazucchi, Morten L. Kringelbach, Gustavo Deco
Publié dans: Communications Biology, Numéro 5, 2023, ISSN 2399-3642
Éditeur: Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-03576-6

Patterns of gray and white matter functional networks involvement in glioblastoma patients: indirect mapping from clinical MRI scans

Auteurs: Giulio Sansone, Lorenzo Pini, Alessandro Salvalaggio, Matteo Gaiola, Francesco Volpin, Valentina Baro, Marta Padovan, Mariagiulia Anglani, Silvia Facchini, Franco Chioffi, Vittorina Zagonel, Domenico D’Avella, Luca Denaro, Giuseppe Lombardi, Maurizio Corbetta
Publié dans: Frontiers in Neurology, Numéro 14, 2023, ISSN 1664-2295
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fneur.2023.1175576

Webcam eye tracking close to laboratory standards: Comparing a new webcam-based system and the EyeLink 1000

Auteurs: Tobiasz Kaduk, Caspar Goeke, Holger Finger, Peter König
Publié dans: Behavior Research Methods, Numéro 56, 2024, Page(s) 5002-5022, ISSN 1554-3528
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.3758/s13428-023-02237-8

The GLM-spectrum: A multilevel framework for spectrum analysis with covariate and confound modelling

Auteurs: Andrew J. Quinn, Lauren Z. Atkinson, Chetan Gohil, Oliver Kohl, Jemma Pitt, Catharina Zich, Anna C. Nobre, Mark W. Woolrich
Publié dans: Imaging Neuroscience, Numéro 2, 2024, Page(s) 1-26, ISSN 2837-6056
Éditeur: MIT Press Direct
DOI: 10.1162/imag_a_00082

Within-cycle instantaneous frequency profiles report oscillatory waveform dynamics

Auteurs: Quinn AJ, Lopes-dos-Santos V, Huang N, Liang W-K, Juan C-H, Yeh J-R, Nobre AC, Dupret D, and Woolrich MW
Publié dans: Journal of Neurophysiology, Numéro 126:4, 2021, Page(s) 1190-1208, ISSN 1522-1598
Éditeur: American Physiological Society
DOI: 10.1152/jn.00201.2021

Basal ganglia reign through downstream control of motor centers in midbrain and brain stem while updating cortex with efference copy information

Auteurs: Grillner S and Thompson WS
Publié dans: Neuron, Numéro 109(10), 2021, Page(s) 1587-1589, ISSN 1097-4199
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2021.04.015

Group‐level brain decoding with deep learning

Auteurs: Richard Csaky, Mats W. J. van Es, Oiwi Parker Jones, Mark Woolrich
Publié dans: Human Brain Mapping, Numéro 44, 2023, Page(s) 6105-6119, ISSN 1065-9471
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.26500

Developmental decrease of entorhinal-hippocampal communication in immune-challenged DISC1 knockdown mice

Auteurs: Xiaxia Xu, Lingzhen Song, Rebecca Kringel, Ileana L. Hanganu-Opatz
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-27114-w

Multi-dynamic Modelling Reveals Strongly Time-varying Resting fMRI Correlations

Auteurs: Usama Pervaiz, Diego Vidaurre, Chetan Gohil, Stephen M. Smith, Mark W. Woolrich
Publié dans: Medical Image Analysis, Numéro 77:102366, 2022, ISSN 1361-8423
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1101/2021.06.23.449584

Patient-specific modeling for guided rehabilitation of stroke patients: the BrainX3 use-case

Auteurs: Vivek Sharma, Francisco Páscoa dos Santos, Paul F. M. J. Verschure
Publié dans: Frontiers in Neurology, Numéro 14, 2023, ISSN 1664-2295
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fneur.2023.1279875

Pregnancy-induced maternal microchimerism shapes neurodevelopment and behavior in mice

Auteurs: Steven Schepanski, Mattia Chini, Veronika Sternemann, Christopher Urbschat, Kristin Thiele, Ting Sun, Yu Zhao, Mareike Poburski, Anna Woestemeier, Marie-Theres Thieme, Dimitra E. Zazara, Malik Alawi, Nicole Fischer, Joerg Heeren, Nikita Vladimirov, Andrew Woehler, Victor G. Puelles, Stefan Bonn, Nicola Gagliani, Ileana L. Hanganu-Opatz, Petra C. Arck
Publié dans: Nature Communications, Numéro 13, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32230-2

The human posterior parietal cortex: effective connectome, and its relation to function

Auteurs: Edmund T Rolls, Gustavo Deco, Chu-Chung Huang, Jianfeng Feng
Publié dans: Cerebral Cortex, Numéro 33, 2023, Page(s) 3142-3170, ISSN 1047-3211
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/cercor/bhac266

Interpretable full-epoch multiclass decoding for M/EEG

Auteurs: Richard Csaky, Mats W.J. van Es, Oiwi Parker Jones, Mark Woolrich
Publié dans: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.03.13.532375

The cortical neurophysiological signature of amyotrophic lateral sclerosis

Auteurs: Michael Trubshaw, Chetan Gohil, Katie Yoganathan, Oliver Kohl, Evan Edmond, Malcolm Proudfoot, Alexander G Thompson, Kevin Talbot, Charlotte J Stagg, Anna C Nobre, Mark Woolrich, Martin R Turner
Publié dans: Brain Communications, Numéro 6, 2024, ISSN 2632-1297
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/braincomms/fcae164

Data and model considerations for estimating time-varying functional connectivity in fMRI

Auteurs: C Ahrends, A Stevner, U Pervaiz, ML Kringelbach, P Vuust, MW Woolrich, D Vidaurre
Publié dans: NeuroImage, Numéro 252, 2022, Page(s) 119026, ISSN 1053-8119
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2022.119026

Inferring the dynamical effects of stroke lesions through whole-brain modeling

Auteurs: Sebastian Idesis, Chiara Favaretto, Nicholas V. Metcalf, Joseph C. Griffis, Gordon L. Shulman, Maurizio Corbetta, Gustavo Deco
Publié dans: NeuroImage: Clinical, Numéro 36, 2023, Page(s) 103233, ISSN 2213-1582
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nicl.2022.103233

Structural cerebellar reserve positively influences outcome after severe stroke

Auteurs: Fatemeh Sadeghihassanabadi, Benedikt M Frey, Winifried Backhaus, Chi-un Choe, Simone Zittel, Gerhard Schön, Marlene Bönstrup, Bastian Cheng, Götz Thomalla, Christian Gerloff, Robert Schulz
Publié dans: Brain Communications, Numéro 4, 2022, ISSN 2632-1297
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/braincomms/fcac203

Bridging the gap between single receptor type activity and whole‐brain dynamics

Auteurs: Dirk Jancke; Stefan Herlitze; Morten L. Kringelbach; Gustavo Deco
Publié dans: The FEBS Journal, 2021, ISSN 1742-4658
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/febs.15855

Functional harmonics reveal multi-dimensional basis functions underlying cortical organization

Auteurs: Katharina Glomb, Morten L. Kringelbach, Gustavo Deco, Patric Hagmann, Joel Pearson, Selen Atasoy
Publié dans: Cell Reports, Numéro 36, 2022, Page(s) 109554, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109554

Dynamical consequences of regional heterogeneity in the brain’s transcriptional landscape

Auteurs: Gustavo Deco, Kevin Aquino, Aurina Arnatkevičiūtė, Stuart Oldham, Kristina Sabaroedin, Nigel C. Rogasch, Morten L. Kringelbach, Alex Fornito
Publié dans: Science Advances, Numéro 7(29), 2024, ISSN 2375-2548
Éditeur: AAAS
DOI: 10.1101/2020.10.28.359943

Excitatory-inhibitory homeostasis and bifurcation control in the Wilson-Cowan model of cortical dynamics

Auteurs: Francisco Páscoa dos Santos, Paul F. M. J. Verschure
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 21, 2025, Page(s) e1012723, ISSN 1553-7358
Éditeur: Public library of science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1012723

Characterisation of laminar and vascular spatiotemporal dynamics of CBV and BOLD signals using VASO and ME-GRE at 7T in humans

Auteurs: Sebastian Dresbach, Renzo Huber, Omer Faruk Gulban, Alessandra Pizzuti, Robert Trampel, Dimo Ivanov, Nikolaus Weiskopf, Rainer Goebel
Publié dans: Imaging Neuroscience, Numéro 2, 2024, Page(s) 1-16, ISSN 2837-6056
Éditeur: MIT Press
DOI: 10.1101/2024.01.25.576050

Modelling on the very large-scale connectome

Auteurs: Géza Ódor; Michael T Gastner; Jeffrey Kelling; Gustavo Deco
Publié dans: Journal of Physics: Complexity, Numéro 2, 2021, Page(s) 045002, ISSN 2632-072X
Éditeur: IOP Publishing
DOI: 10.1088/2632-072x/ac266c

Redefining stroke rehabilitation: Mobilizing the embodied goal-oriented brain

Auteurs: Paul F.M.J. Verschure, Francisco Páscoa dos Santos, Vivek Sharma
Publié dans: Current Opinion in Neurobiology, Numéro 83, 2024, Page(s) 102807, ISSN 0959-4388
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.conb.2023.102807

Spatiotemporally Resolved Multivariate Pattern Analysis for M/EEG

Auteurs: Cameron Higgins, Diego Vidaurre, Nils Kolling, Yunzhe Liu, Tim Behrens, Mark Woolrich
Publié dans: Human Brain Mapping, Numéro 43(10), 2022, Page(s) 3062-3085, ISSN 1097-0193
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1101/2021.08.17.456594

Different MRI structural processing methods do not impact functional connectivity computation

Auteurs: Lu Zhang, Lorenzo Pini, Maurizio Corbetta
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 13, 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-34645-3

The arrow of time of brain signals in cognition: Potential intriguing role of parts of the default mode network

Auteurs: Gustavo Deco, Yonatan Sanz Perl, Laura de la Fuente, Jacobo D. Sitt, B. T. Thomas Yeo, Enzo Tagliazucchi, Morten L. Kringelbach
Publié dans: Network Neuroscience, Numéro 7, 2023, Page(s) 966-998, ISSN 2472-1751
Éditeur: MIT Press Direct
DOI: 10.1162/netn_a_00300

The Gaussian-Linear Hidden Markov model: a Python package

Auteurs: Vidaurre, Diego; Larsen, Nick Y.; Masaracchia, Laura; Ruijters, Lenno R. P. T; Alonso, Sonsoles; Ahrends, Christine; Woolrich, Mark W.
Publié dans: arXiv, Numéro arXiv:2312.07151, 2023, ISSN 2331-8422
Éditeur: Cornell University
DOI: 10.48550/arxiv.2312.07151

Metastable Dynamics Emerge from Local Excitatory-Inhibitory Homeostasis in the Cortex at Rest

Auteurs: Francisco Páscoa dos Santos, Paul FMJ Verschure
Publié dans: buiRxiv, Numéro 2024.08.24.609501, 2024, ISSN 2692-8205
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.08.24.609501

Deep learning the arrow of time in brain activity: characterising brain-environment behavioural interactions in health and disease

Auteurs: Gustavo Deco, Yonatan Sanz Perl, Jacobo D. Sitt, Enzo Tagliazucchi, Morten L. Kringelbach
Publié dans: bioRxiv, 2021, ISSN 2692-8205
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2021.07.02.450899

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