Descripción del proyecto
Las aves cantoras cantan de forma distinta cuando se trata de sus células germinales
En los organismos pluricelulares que se reproducen sexualmente, las células se clasifican, a grandes rasgos, en somáticas y germinales; estas últimas forman los gametos (óvulos y espermatozoides). La mayoría de los animales, incluidos los humanos, tienen los mismos cromosomas en todas sus células, aunque la mayoría de las células contienen dos copias y los gametos solo una. Sin embargo, las cantoras son una excepción misteriosa. Sus células germinales tienen un cromosoma adicional, el llamado cromosoma restringido a la línea germinal (GRC, por sus siglas en inglés), que no se encuentra en las células somáticas. Esto abre la puerta a posibilidades interesantes relacionadas con la expresión génica específica de la línea germinal, aunque el GRC es poco conocido. El proyecto birdGRC, financiado con fondos europeos, utiliza métodos de alta tecnología para identificar los genes más «antiguos» y, por consiguiente, probablemente los más importantes del GRC y estudiar el papel que desempeñan en el desarrollo y la evolución de los paseriformes, el grupo de pájaros que agrupa a más especies.
Objetivo
Metazoans typically keep the same genetic information in all body cells over their life cycle. However, some organisms show exceptions to this rule through programmed DNA elimination from the somatic cell line, as it is the case of the puzzling germline-restricted chromosome (GRC) in songbirds. Recently, it has been demonstrated that the GRC is likely present in over half of all bird species and that the zebra finch GRC is enriched in developmental genes. The latter constitutes a novel mechanism for germline-specific gene expression in multicellular organisms, which is of significant relevance to fields as genomics, developmental biology, ecology or even cancer research. However, it remains mysterious how the GRC affects differential gene expression between tissues, the genomic divergence between species, and the determination of cell fate between germline and soma. To elucidate this, we will first perform multiplatform sequencing and high-quality assembly of the GRC in the zebra finch. Then, by comparing somatic and germline genomes from many bird species to infer the evolutionary trajectories of the GRC, we will determine its most ancient and, therefore, important genes. Finally, we will perform a functional analysis to elucidate the role of these genes in primordial germ cells and the early transmission in embryos. Recent technological advances in sequencing, bioinformatics and developmental biology provide us now with a unique moment to perform the proposed multi-omics analyses. Successful and high-quality implementation will be ensured by the extensive experience of the fellow in cytogenetics and genomics of supernumerary chromosomes as well as in developmental biology in zebrafish. In addition, the host lab is expert in cutting-edge multiplatform genomics techniques and has a multidisciplinary network of collaborators, and the secondment partner is expert in experimental biology with zebra finch embryos and primordial germ cell cultures.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
NR4 7TJ Norwich
Reino Unido