Virus inhibition of oceanic CO2 fixation

Informations projet

VirFix

N° de convention de subvention: 883551

DOI

10.3030/883551

Projet clôturé

Date de signature de la CE 2 Juin 2020

Date de début 1 Janvier 2021

Date de fin 31 Mars 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 499 997,50

Contribution de l’UE

€ 2 499 997,50

Coordonné par

UNIVERSITY OF WARWICK
United Kingdom

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Publications

Peer reviewed articles (13)

A distinct, high-affinity, alkaline phosphatase facilitates occupation of P-depleted environments by marine picocyanobacteria

Auteurs: Alberto Torcello-Requena, Andrew R. J. Murphy, Ian D. E. A. Lidbury, Frances D. Pitt, Richard Stark, Andrew D. Millard, Richard J. Puxty, Yin Chen, David J. Scanlan
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, Page(s) e2312892121, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2312892121

Coordinated transcriptional response to environmental stress by a <i>Synechococcus</i> virus

Auteurs: Branko Rihtman, Alberto Torcello-Requena, Alevtina Mikhaylina, Richard J Puxty, Martha R J Clokie, Andrew D Millard, David J Scanlan
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 18, 2025, Page(s) wrae032, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1093/ismejo/wrae032

Structural basis and evolutionary pathways of glycerol-1-phosphate transport in marine bacteria

Auteurs: Ning Wang, Linda M. Westermann, Mingyu Li, Chun-Yang Li, Andrew R. J. Murphy, Zengtian Gu, Eleonora Silvano, Claudia A. Blindauer, Ian D. E. A. Lidbury, Yu-Zhong Zhang, David J. Scanlan, Yin Chen
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 122, 2025, Page(s) e2524546122 1-9, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2524546122

α-cyanobacteria possessing form IA RuBisCO globally dominate aquatic habitats

Auteurs: P. J. Cabello-Yeves, D. J. Scanlan, C. Callieri, A. Picazo, L. Schallenberg, P. Huber, J. J. Roda-Garcia, M. Bartosiewicz, O. I. Belykh, I. V. Tikhonova, A. Torcello, P. Martin De Prado, A. Millard, A. Camacho, F. Rodriguez-Valera and R. J. Puxty.
Publié dans: The ISME Journal, 2022, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-022-01282-z

The long and short of it: benchmarking viromics using Illumina, Nanopore and PacBio sequencing technologies

Auteurs: Ryan Cook, Nathan Brown, Branko Rihtman, Slawomir Michniewski, Tamsin Redgwell, Martha Clokie, Dov J. Stekel, Yin Chen, David J. Scanlan, Jon L. Hobman, Andrew Nelson, Michael A. Jones, Darren Smith, Andrew Millard
Publié dans: Microbial Genomics, Numéro 10, 2024, Page(s) 001198, ISSN 2057-5858
Éditeur: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.001198

Bacterial catabolism of membrane phospholipids links marine biogeochemical cycles

Auteurs: Linda Westermann, Ian D. E. A. Lidbury, Chun-Yang Li, Ning Wang, Andrew R.J. Murphy, Maria del Mar Aguilo Ferretjans, Mussa Quareshy, Muralidharan Shanmugan, Alberto Torcello-Requena, Eleonora Silvano, Yu-Zhong Zhang, Claudia Blindauer, Yin Chen, and David J. Scanlan
Publié dans: Science Advances, Numéro 9, 2023, Page(s) eadf5122, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.adf5122

Differential global distribution of marine picocyanobacteria gene clusters reveals distinct niche-related adaptive strategies

Auteurs: Hugo Doré, Ulysse Guyet, Jade Leconte, Gregory K Farrant, Benjamin Alric, Morgane Ratin, Martin Ostrowski, Mathilde Ferrieux, Loraine Brillet-Guéguen, Mark Hoebeke, Jukka Siltanen, Gildas Le Corguillé, Erwan Corre, Patrick Wincker, David J Scanlan, Damien Eveillard, Frédéric Partensky, Laurence Garczarek
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 17, 2024, Page(s) 720-732, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-023-01386-0

Rolling out Plaque-2-seq: a single plaque sequencing approach enabling rapid, low-cost sequencing of phages directly from plaques

Auteurs: Slawomir Michniewski, Rebecca Glenny, Andrew Kinsella, Kane Porter, Kayne Wright, Sophie Harrison, Nzubechukwu I Ugokwe, Amani Alrashidi, Srwa.J. Rashid, Chisomaga Eke, Jack C.D. Lee, Faizal Patel, Theo Josephs, Arezoo Pedramfar, Max Coleman, Hasanain F.Y Al-Dahash, Gibson A. Sabuholo, Navodya S. Roemer, Hannah Sampson, Gerald N. Misol Jr, Branko Rihtman, David J. Scanlan, Elspeth Smith, Graham St
Publié dans: Microbial Genomics, Numéro 12, 2026, Page(s) 001672 1-12, ISSN 2057-5858
Éditeur: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.001672

More realistic plankton simulation models will improve projections of ocean ecosystem responses to global change

Auteurs: Kevin J. Flynn, Angus Atkinson, John Beardall, John A. Berges, Maarten Boersma, Christophe Brunet, Albert Calbet, Dave A. Caron, Hans G. Dam, Patricia M. Glibert, Per Juel Hansen, Peng Jin, Christian Lønborg, Daniel J. Mayor, Susanne Menden-Deuer, Thomas Mock, Margaret R. Mulholland, David M. Needham, Luca Polimene, Alex J. Poulton, Carol Robinson, Sebastian D. Rokitta, Björn Rost, Enric Saiz, D
Publié dans: Nature Ecology &amp; Evolution, Numéro 9, 2025, Page(s) 1562-1570, ISSN 2397-334X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41559-025-02788-3

Elucidating the picocyanobacteria salinity divide through ecogenomics of new freshwaterisolates

Auteurs: P. J. Cabello-Yeves, C. Callieri, A. Picazo, L. Schallenberg, P. Huber, J. J. Roda-Garcia, M. Bartosiewicz, O. I. Belykh, I. V. Tikhonova, A. Torcello, P. Martin De Prado, R. J. Puxty, A. Millard, A. Camacho, F. Rodriguez-Valera and D. J. Scanlan.
Publié dans: BMC Biology, Numéro 20, 2022, Page(s) 175, ISSN 1741-7007
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-022-01379-z

Global Phylogeography of Marine <i>Synechococcus</i> in Coastal Areas Reveals Strong Community Shifts

Auteurs: Hugo Doré, Jade Leconte, Ulysse Guyet, Solène Breton, Gregory K. Farrant, David Demory, Morgane Ratin, Mark Hoebeke, Erwan Corre, Frances D. Pitt, Martin Ostrowski, David J. Scanlan, Frédéric Partensky, Christophe Six, Laurence Garczarek
Publié dans: mSystems, Numéro 7, 2024, Page(s) 10.1128/msystems.00656-22, ISSN 2379-5077
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msystems.00656-22

Methionine synthesis and glycine betaine demethylation are intricately intertwined in cosmopolitan marine bacteria

Auteurs: Michaela A. Mausz, Andrew R. J. Murphy, Maria del Mar Aguilo-Ferretjans, Andrew Hitchcock, Mary Ann Moran, David J. Scanlan, Yin Chen, Ian D. E. A. Lidbury
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 122, 2025, Page(s) e2426167122 1-10, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2426167122

Aminolipids in bacterial membranes and the natural environment

Auteurs: Shengwei Liu, Eleonora Silvano, Mingyu Li, Michaela Mausz, Branko Rihtman, Richard Guillonneau, Otto Geiger, David J Scanlan, Yin Chen
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 18, 2024, Page(s) wrae229, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1093/ismejo/wrae229