Virus inhibition of oceanic CO2 fixation

Informazioni relative al progetto

VirFix

ID dell’accordo di sovvenzione: 883551

DOI

10.3030/883551

Progetto chiuso

Data della firma CE 2 Giugno 2020

Data di avvio 1 Gennaio 2021

Data di completamento 31 Marzo 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 499 997,50

Contributo UE

€ 2 499 997,50

Coordinato da

UNIVERSITY OF WARWICK
United Kingdom

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (13)

A distinct, high-affinity, alkaline phosphatase facilitates occupation of P-depleted environments by marine picocyanobacteria

Autori: Alberto Torcello-Requena, Andrew R. J. Murphy, Ian D. E. A. Lidbury, Frances D. Pitt, Richard Stark, Andrew D. Millard, Richard J. Puxty, Yin Chen, David J. Scanlan
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 121, 2024, Pagina/e e2312892121, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2312892121

Coordinated transcriptional response to environmental stress by a <i>Synechococcus</i> virus

Autori: Branko Rihtman, Alberto Torcello-Requena, Alevtina Mikhaylina, Richard J Puxty, Martha R J Clokie, Andrew D Millard, David J Scanlan
Pubblicato in: The ISME Journal, Numero 18, 2025, Pagina/e wrae032, ISSN 1751-7362
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1093/ismejo/wrae032

Structural basis and evolutionary pathways of glycerol-1-phosphate transport in marine bacteria

Autori: Ning Wang, Linda M. Westermann, Mingyu Li, Chun-Yang Li, Andrew R. J. Murphy, Zengtian Gu, Eleonora Silvano, Claudia A. Blindauer, Ian D. E. A. Lidbury, Yu-Zhong Zhang, David J. Scanlan, Yin Chen
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 122, 2025, Pagina/e e2524546122 1-9, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2524546122

α-cyanobacteria possessing form IA RuBisCO globally dominate aquatic habitats

Autori: P. J. Cabello-Yeves, D. J. Scanlan, C. Callieri, A. Picazo, L. Schallenberg, P. Huber, J. J. Roda-Garcia, M. Bartosiewicz, O. I. Belykh, I. V. Tikhonova, A. Torcello, P. Martin De Prado, A. Millard, A. Camacho, F. Rodriguez-Valera and R. J. Puxty.
Pubblicato in: The ISME Journal, 2022, ISSN 1751-7362
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-022-01282-z

The long and short of it: benchmarking viromics using Illumina, Nanopore and PacBio sequencing technologies

Autori: Ryan Cook, Nathan Brown, Branko Rihtman, Slawomir Michniewski, Tamsin Redgwell, Martha Clokie, Dov J. Stekel, Yin Chen, David J. Scanlan, Jon L. Hobman, Andrew Nelson, Michael A. Jones, Darren Smith, Andrew Millard
Pubblicato in: Microbial Genomics, Numero 10, 2024, Pagina/e 001198, ISSN 2057-5858
Editore: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.001198

Bacterial catabolism of membrane phospholipids links marine biogeochemical cycles

Autori: Linda Westermann, Ian D. E. A. Lidbury, Chun-Yang Li, Ning Wang, Andrew R.J. Murphy, Maria del Mar Aguilo Ferretjans, Mussa Quareshy, Muralidharan Shanmugan, Alberto Torcello-Requena, Eleonora Silvano, Yu-Zhong Zhang, Claudia Blindauer, Yin Chen, and David J. Scanlan
Pubblicato in: Science Advances, Numero 9, 2023, Pagina/e eadf5122, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.adf5122

Differential global distribution of marine picocyanobacteria gene clusters reveals distinct niche-related adaptive strategies

Autori: Hugo Doré, Ulysse Guyet, Jade Leconte, Gregory K Farrant, Benjamin Alric, Morgane Ratin, Martin Ostrowski, Mathilde Ferrieux, Loraine Brillet-Guéguen, Mark Hoebeke, Jukka Siltanen, Gildas Le Corguillé, Erwan Corre, Patrick Wincker, David J Scanlan, Damien Eveillard, Frédéric Partensky, Laurence Garczarek
Pubblicato in: The ISME Journal, Numero 17, 2024, Pagina/e 720-732, ISSN 1751-7362
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-023-01386-0

Rolling out Plaque-2-seq: a single plaque sequencing approach enabling rapid, low-cost sequencing of phages directly from plaques

Autori: Slawomir Michniewski, Rebecca Glenny, Andrew Kinsella, Kane Porter, Kayne Wright, Sophie Harrison, Nzubechukwu I Ugokwe, Amani Alrashidi, Srwa.J. Rashid, Chisomaga Eke, Jack C.D. Lee, Faizal Patel, Theo Josephs, Arezoo Pedramfar, Max Coleman, Hasanain F.Y Al-Dahash, Gibson A. Sabuholo, Navodya S. Roemer, Hannah Sampson, Gerald N. Misol Jr, Branko Rihtman, David J. Scanlan, Elspeth Smith, Graham St
Pubblicato in: Microbial Genomics, Numero 12, 2026, Pagina/e 001672 1-12, ISSN 2057-5858
Editore: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mgen.0.001672

More realistic plankton simulation models will improve projections of ocean ecosystem responses to global change

Autori: Kevin J. Flynn, Angus Atkinson, John Beardall, John A. Berges, Maarten Boersma, Christophe Brunet, Albert Calbet, Dave A. Caron, Hans G. Dam, Patricia M. Glibert, Per Juel Hansen, Peng Jin, Christian Lønborg, Daniel J. Mayor, Susanne Menden-Deuer, Thomas Mock, Margaret R. Mulholland, David M. Needham, Luca Polimene, Alex J. Poulton, Carol Robinson, Sebastian D. Rokitta, Björn Rost, Enric Saiz, D
Pubblicato in: Nature Ecology &amp; Evolution, Numero 9, 2025, Pagina/e 1562-1570, ISSN 2397-334X
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41559-025-02788-3

Elucidating the picocyanobacteria salinity divide through ecogenomics of new freshwaterisolates

Autori: P. J. Cabello-Yeves, C. Callieri, A. Picazo, L. Schallenberg, P. Huber, J. J. Roda-Garcia, M. Bartosiewicz, O. I. Belykh, I. V. Tikhonova, A. Torcello, P. Martin De Prado, R. J. Puxty, A. Millard, A. Camacho, F. Rodriguez-Valera and D. J. Scanlan.
Pubblicato in: BMC Biology, Numero 20, 2022, Pagina/e 175, ISSN 1741-7007
Editore: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-022-01379-z

Global Phylogeography of Marine <i>Synechococcus</i> in Coastal Areas Reveals Strong Community Shifts

Autori: Hugo Doré, Jade Leconte, Ulysse Guyet, Solène Breton, Gregory K. Farrant, David Demory, Morgane Ratin, Mark Hoebeke, Erwan Corre, Frances D. Pitt, Martin Ostrowski, David J. Scanlan, Frédéric Partensky, Christophe Six, Laurence Garczarek
Pubblicato in: mSystems, Numero 7, 2024, Pagina/e 10.1128/msystems.00656-22, ISSN 2379-5077
Editore: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msystems.00656-22

Methionine synthesis and glycine betaine demethylation are intricately intertwined in cosmopolitan marine bacteria

Autori: Michaela A. Mausz, Andrew R. J. Murphy, Maria del Mar Aguilo-Ferretjans, Andrew Hitchcock, Mary Ann Moran, David J. Scanlan, Yin Chen, Ian D. E. A. Lidbury
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 122, 2025, Pagina/e e2426167122 1-10, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2426167122

Aminolipids in bacterial membranes and the natural environment

Autori: Shengwei Liu, Eleonora Silvano, Mingyu Li, Michaela Mausz, Branko Rihtman, Richard Guillonneau, Otto Geiger, David J Scanlan, Yin Chen
Pubblicato in: The ISME Journal, Numero 18, 2024, Pagina/e wrae229, ISSN 1751-7362
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1093/ismejo/wrae229