Descripción del proyecto
Evaluación de la historia evolutiva de las aves
Las ciencias biológicas, médicas y agrícolas se basan en datos de secuencias a escala genómica para extraer firmas históricas de la divergencia entre las especies y las poblaciones. La filogenómica es un conjunto de técnicas que permite analizar datos genómicos y reconstrucciones evolutivas. Sin embargo, los métodos filogenómicos existentes no permiten detectar el efecto de factores específicos de la información histórica a lo largo de genomas completos. El proyecto financiado con fondos europeos EvolInfome tiene por objeto desarrollar pruebas para calcular el efecto de las fuerzas evolutivas primarias sobre los genomas de la vasta familia aviar. Asimismo, creará un nuevo marco de adecuación de modelos que hará posible un examen integrador de la señal informativa dejada por fuerzas evolutivas fundamentales, lo que ofrecerá datos sobre la historia evolutiva de las aves. Los investigadores accederán a los resultados a través de un paquete de «software».
Objetivo
Genome-scale sequence data play an important role across the biological, medical, and agricultural sciences for extracting the signatures of divergence among species and populations. Multiple basic biological forces influence the evolutionary information content of genomes, leading to substantial variation across genomic loci and lineages. Models of molecular evolution for phylogenomics are routinely used for extracting information about evolutionary history, and ultimately for making inferences of the relationships and amount of evolutionary change among taxa. However, existing phylogenomic methods are not amenable for identifying the impact of specific drivers of historical information across whole genomes. The present action will develop tests in the framework of model adequacy for assessing the impact of the primary evolutionary forces on the genome. Assessment of model adequacy proceeds by comparing simulated data under a given evolutionary model with empirical data. The novel framework will be tailored at whole-genome analysis. It will allow a comprehensive examination of the sources information signal left by basic evolutionary forces, such as speciation, mutation, selection, recombination, and drift. The new methods will be disseminated through an intuitive software package that will be openly available for researchers across biological sciences. Examining the sources of evolutionary information will allow improved phylogenetic inferences and guide model improvement. An unparalleled genomic resource of the genomes of every avian family, soon to be released by the host, will be examined in detail with the methods developed. This will provide insights into genome evolution in birds and inferences of their evolutionary history with unprecedented confidence.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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- ciencias naturalesciencias biológicasbiología evolutiva
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
1165 Kobenhavn
Dinamarca