Description du projet
Évaluer l’histoire évolutive des oiseaux
Les sciences agricoles, médicales et biologiques dépendent des données sur les séquences génomiques pour extraire des signatures anciennes de divergence au sein des espèces et des populations. La phylogénomique est un ensemble de techniques capables d’apporter une analyse des données génomique et des reconstructions évolutives. Toutefois, les méthodes phylogénomiques actuelles ne peuvent pas détecter l’impact de vecteurs spécifiques des informations anciennes à travers des génomes entiers. Le projet EvolInfome, financé par l’UE, entend mettre au point des tests pour estimer l’impact des principales forces évolutives sur les génomes de la vaste famille des oiseaux. Le projet établira un nouveau cadre d’adéquation qui permettra un examen inclusif du signal d’information laissé par des forces évolutives fondamentales, apportant ainsi des informations sur l’histoire évolutive des oiseaux. Les chercheurs auront accès aux résultats à l’aide d’un progiciel.
Objectif
Genome-scale sequence data play an important role across the biological, medical, and agricultural sciences for extracting the signatures of divergence among species and populations. Multiple basic biological forces influence the evolutionary information content of genomes, leading to substantial variation across genomic loci and lineages. Models of molecular evolution for phylogenomics are routinely used for extracting information about evolutionary history, and ultimately for making inferences of the relationships and amount of evolutionary change among taxa. However, existing phylogenomic methods are not amenable for identifying the impact of specific drivers of historical information across whole genomes. The present action will develop tests in the framework of model adequacy for assessing the impact of the primary evolutionary forces on the genome. Assessment of model adequacy proceeds by comparing simulated data under a given evolutionary model with empirical data. The novel framework will be tailored at whole-genome analysis. It will allow a comprehensive examination of the sources information signal left by basic evolutionary forces, such as speciation, mutation, selection, recombination, and drift. The new methods will be disseminated through an intuitive software package that will be openly available for researchers across biological sciences. Examining the sources of evolutionary information will allow improved phylogenetic inferences and guide model improvement. An unparalleled genomic resource of the genomes of every avian family, soon to be released by the host, will be examined in detail with the methods developed. This will provide insights into genome evolution in birds and inferences of their evolutionary history with unprecedented confidence.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- sciences naturellesinformatique et science de l'informationlogiciel
- sciences naturellessciences biologiquesbiologie de l'évolution
- sciences naturellessciences biologiquesgénétiquemutation
- sciences naturellessciences biologiquesgénétiquegénome
- sciences naturellessciences biologiquesbiologie moléculaireévolution moléculaire
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Mots‑clés
Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
Voir d’autres projets de cet appelRégime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
1165 Kobenhavn
Danemark