1,000 ancient genomes: gene-economy innovation in cattle, sheep and goat

Informations projet

AncestralWeave

N° de convention de subvention: 885729

DOI

10.3030/885729

Date de signature de la CE 6 Mai 2020

Date de début 1 Decembre 2020

Date de fin 30 Novembre 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 499 198,75

Contribution de l’UE

€ 2 499 198,75

Coordonné par

THE PROVOST, FELLOWS, FOUNDATION SCHOLARS & THE OTHER MEMBERS OF BOARD, OF THE COLLEGE OF THE HOLY & UNDIVIDED TRINITY OF QUEEN ELIZABETH NEAR DUBLIN
Ireland

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Publications

Peer reviewed articles (10)

Herded and hunted goat genomes from the dawn of domestication in the Zagros Mountains

Auteurs: Daly KG, Mattiangeli V, Hare AJ, Davoudi H, Fathi H, Doost SB, Amiri S, Khazaeli R, Decruyenaere D, Nokandeh J, Richter T, Darabi H, Mortensen P, Pantos A, Yeomans L, Bangsgaard P, Mashkour M, Zeder MA, Bradley DG
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2100901118

The genomic history and global expansion of domestic donkeys

Auteurs: Evelyn T. Todd; Laure Tonasso-Calvière; Loreleï Chauvey; Stéphanie Schiavinato; Antoine Fages; Andaine Seguin-Orlando; Pierre Clavel; Naveed Khan; Lucía Pérez Pardal; Laura Patterson Rosa; Pablo Librado; Harald Ringbauer; Marta Verdugo; John Southon; Jean-Marc Aury; Aude Perdereau; Emmanuelle Vila; Matilde Marzullo; Ornella Prato; Umberto Tecchiati; Giovanna Bagnasco Gianni; Antonio Tagliacoz
Publié dans: Science, Numéro 2, 2022, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abo3503

The genomic natural history of the aurochs

Auteurs: Conor Rossi, Mikkel-Holger S. Sinding, Victoria E. Mullin, Amelie Scheu, Jolijn A. M. Erven, Marta Pereira Verdugo, Kevin G. Daly, Marta Maria Ciucani, Valeria Mattiangeli, Matthew D. Teasdale, Deborah Diquelou, Aurélie Manin, Pernille Bangsgaard, Matthew Collins, Tom C. Lord, Viktor Zeibert, Roberto Zorzin, Michael Vinter, Zena Timmons, Andrew C. Kitchener, Martin Street, Ashleigh F. Haruda, Kri
Publié dans: Nature, Numéro 635, 2024, Page(s) 136-141, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-08112-6

Ancient mitogenomes from Pre-Pottery Neolithic Central Anatolia and the effects of a Late Neolithic bottleneck in sheep ( <i>Ovis aries</i> )

Auteurs: Edson Sandoval-Castellanos, Andrew J. Hare, Audrey T. Lin, Evangelos A. Dimopoulos, Kevin G. Daly, Sheila Geiger, Victoria E. Mullin, Ingrid Wiechmann, Valeria Mattiangeli, Gesine Lühken, Natalia A. Zinovieva, Petar Zidarov, Canan Çakırlar, Simon Stoddart, David Orton, Jelena Bulatović, Marjan Mashkour, Eberhard W. Sauer, Liora Kolska Horwitz, Barbara Horejs, Levent Atici, Vecihi Özkaya, Jacq
Publié dans: Science Advances, Numéro 10, 2024, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.adj0954

Ancient genomics and the origin, dispersal, and development of domestic sheep

Auteurs: Kevin G. Daly, Victoria E. Mullin, Andrew J. Hare, Áine Halpin, Valeria Mattiangeli, Matthew D. Teasdale, Conor Rossi, Sheila Geiger, Stefan Krebs, Ivica Medugorac, Edson Sandoval-Castellanos, Mihriban Özbaşaran, Güneş Duru, Sevil Gülcür, Nadja Pöllath, Matthew Collins, Laurent Frantz, Emmanuelle Vila, Peter Zidarov, Simon Stoddart, Bazartseren Boldgiv, Ludovic Orlando, Mike Parker Pearson
Publié dans: Science, Numéro 387, 2025, Page(s) 492-497, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adn2094

An 8000 years old genome reveals the Neolithic origin of the zoonosis Brucella melitensis

Auteurs: Louis L’Hôte, Ian Light, Valeria Mattiangeli, Matthew D. Teasdale, Áine Halpin, Lionel Gourichon, Felix M. Key, Kevin G. Daly
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-50536-1

Archaeogenomic insights into commensalism and regional variation in pig management in Neolithic northwest Europe

Auteurs: Jolijn A. M. Erven, Valeria Mattiangeli, Merita Dreshaj, Victoria E. Mullin, Conor Rossi, Kevin G. Daly, Iseult Jackson, Mike Parker Pearson, Daniel G. Bradley, Laurent A. F. Frantz, Ole Madsen, Daan Raemaekers, Canan Çakirlar
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 122, 2025, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2410235122

Imputation of Ancient Whole Genome Sus scrofa DNA Introduces Biases Toward Main Population Components in the Reference Panel

Auteurs: J. A. M. Erven, C. Çakirlar, D. G. Bradley, D. C. M. Raemaekers, O. Madsen
Publié dans: Frontiers in Genetics, 2022, ISSN 1664-8021
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2022.872486

A novel lineage of the Capra genus discovered in the Taurus Mountains of Turkey using ancient genomics

Auteurs: Kevin G Daly; Benjamin S Arbuckle; Conor Rossi; Valeria Mattiangeli; Phoebe A Lawlor; Marjan Mashkour; Eberhard Sauer; Joséphine Lesur; Levent Atici; Cevdet Merih Erek; Daniel G Bradley
Publié dans: eLife, Numéro 1, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2022.04.08.487619

A high coverage Mesolithic aurochs genome and effective leveraging of ancient cattle genomes using whole genome imputation

Auteurs: Jolijn A.M Erven, Amelie Scheu, Marta Pereira Verdugo, Lara Cassidy, Ningbo Chen, Birgit Gehlen, Martin Street, Ole Madsen, Victoria E Mullin
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, 2025, ISSN 1537-1719
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2024.01.23.576850