Description du projet
Un atlas moléculaire du cancer du sein
Exploiter le système immunitaire d’un patient pour combattre le cancer dont il est atteint apparaît comme une stratégie thérapeutique prometteuse. L’efficacité limitée des immunothérapies pour traiter le cancer du sein a toutefois suscité un grand intérêt. Le projet SCISSORS, financé par l’UE, propose d’utiliser la génomique unicellulaire, afin d’étudier la manière dont le système immunitaire répond à la tumeur évolutive lorsqu’elle émerge du tissu sain. Les scientifiques développeront un modèle informatique intégrant de multiples aspects du cancer du sein, dont la transition du stade normal à celui de tumeur, l’interaction entre les cellules du sein et celles du système immunitaire, et la dynamique clonale de la tumeur. En plus d’apporter des informations fondamentales sur la biologie du cancer, les conclusions du projet pourraient permettre de dévoiler de nouveaux marqueurs de progression et d’améliorer la stratification des risques.
Objectif
Breast cancer is the most common type of cancer in Europe, responsible for the highest women cancer mortalities each year. Characterisation of breast tumours teased them apart to distinct subtypes and facilitated targeted treatments that improved survival rates significantly, yet some aggressive subtypes remain difficult to treat. New therapies that harness the patient own immune system to fight the tumour show remarkable success in several cancers but limited one in breast cancer. Single cell genomics is the cutting-edge method to profile tissues at the highest resolution. As a computational biologist experienced in this technique, I will use it to analyse breast tumours with their residing immune cells. I aim to dissect the dynamic processes that shape the clonal development of the tumour as it emerges from a healthy tissue, with an emphasis on the immune system response to the evolving tumour. Single cell genomics, being the main driving tool, will be leveraged by integration with vast data from thousands of deeply profiled tumour samples available in the Host lab. The project includes generation of a healthy breast single cell expression atlas; a computational method to infer somatic mutations clones from single cell genomics data; single cell profiling of breast tumours together with adjacent normal tissues; and lastly, integration of the results with data from the large tumours biobank that holds years of clinical history which may reveal new progression markers and improve risk stratification. This plan is unique by accounting for multiple aspects of the tumours, including normal to malignant transition, interplay of breast and immune cells, and tumour clonal dynamics. By tackling common cancer immune mechanisms, it may provide novel insights of relevance to all cancer types. Pursuing this grand project in a leading lab that covers all aspects of breast cancer research will increase my research versatility on my way to become an independent researcher.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences sociales sociologie démographie mortalité
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie cancer du sein
- sciences naturelles informatique et science de l'information science informatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.