Skip to main content
Aller à la page d’accueil de la Commission européenne (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)
français fr
CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS

Impact of RNA modifications on neuronal fate

Description du projet

Les modifications de l’ARN dans le développement neuronal

Les ARN non-codants (ARNnc) apparaissent comme des régulateurs clés d’une pléthore de voies moléculaires sophistiquées. Le projet Rn7SKmod, financé par l’UE, sera axé sur Rn7sk, un ARNnc qui module les résultats de transcription de l’ARN polymérase II. L’objectif consiste à caractériser les modifications de l’ARN dans cette molécule et à déterminer la manière dont elles affectent le recrutement des partenaires protéiques. À l’aide de la spectrométrie de masse de l’ARN et d’un séquençage à l’échelle du génome, les scientifiques étudieront l’impact de ces modifications sur le destin des cellules neuronales et le développement du cerveau. Les résultats du projet fourniront des informations fondamentales sur la régulation du développement neuronal et l’implication des modifications de l’ARN.

Objectif

The Epitranscriptome is the assembly of over 170 chemical RNA modifications that play fundamental roles in the majority of cellular processes. RNA modifying enzymes and proper control of neuronal cell fate are essential for brain development and dysfunction in any of these processes results in severe neurodevelopmental disorders. To date, the role of non-coding RNAs (ncRNAs) as key regulators of sophisticated molecular pathways is becoming increasingly clear. A key regulatory ncRNA that modulates the transcriptional output of RNA polymerase II is Rn7sk. Other abundant ncRNAs, like transfer RNAs and ribosomal RNAs, are highly modified; yet the modifications occurring in Rn7sk are largely unknown. In this proposal, I aim to investigate the Rn7sk RNA modification status and the impact of these modifications on neuronal cell fate and brain development. To accomplish this, I will; i) Characterize Rn7sk RNA modifications using a highly sensitive RNA mass spectrometry approach and evaluate the impact of selected modifications in recruiting protein binding partners using stable isotope labelling by amino acids in cell culture (SILAC) based mass spectrometry; ii) Determine the biological function of selected Rn7sk modifications during neuronal differentiation using genetically manipulated embryonic cell lines; iii) Investigate the role of Rn7sk during brain development using genome-wide sequencing technologies and a forebrain-specific Rn7sk knock-out mouse model. Results stemming from this project will reveal several novel aspects about how neuronal fate is controlled by tiny RNA modifications. My ultimate ambition is to establish my own laboratory and become an independent research leader in the field of Epitranscriptomics. This proposal, with the support from the experienced Prof Frye and the excellent host institute, DKFZ, is key for me to reach my goal.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

Mots‑clés

Programme(s)

Thème(s)

Régime de financement

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

DEUTSCHES KREBSFORSCHUNGSZENTRUM HEIDELBERG
Contribution nette de l'UE
€ 162 806,40
Adresse
IM NEUENHEIMER FELD 280
69120 Heidelberg
Allemagne
Région
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
€ 162 806,40