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Impact of RNA modifications on neuronal fate

Projektbeschreibung

RNA-Modifikationen bei der neuronalen Entwicklung

Nichtcodierende Ribonukleinsäuren (ncRNA) erweisen sich als Schlüsselregulatoren von immer mehr komplexen molekularen Signalwegen. Das EU-finanzierte Projekt Rn7SKmod wird sich genauer mit Rn7sk befassen, einer ncRNA, die die mithilfe von RNA-Polymerase II ablaufende Transkription moduliert. Die RNA-Modifikationen in diesem Molekül sollen charakterisiert werden und es gilt zu bestimmen, wie sie sich auf die Anbindung der Proteinpartner auswirken. Mithilfe von RNA-Massenspektrometrie und genomweiter Sequenzierung wird das Forschungsteam die Wirkung dieser Modifikationen auf die Differenzierung von Nervenzellen und die Gehirnentwicklung betrachten. Die Projektergebnisse liefern schließlich fundamentale Erkenntnisse über die Regulierung der neuronalen Entwicklung und den Einfluss von Modifikationen in der RNA.

Ziel

The Epitranscriptome is the assembly of over 170 chemical RNA modifications that play fundamental roles in the majority of cellular processes. RNA modifying enzymes and proper control of neuronal cell fate are essential for brain development and dysfunction in any of these processes results in severe neurodevelopmental disorders. To date, the role of non-coding RNAs (ncRNAs) as key regulators of sophisticated molecular pathways is becoming increasingly clear. A key regulatory ncRNA that modulates the transcriptional output of RNA polymerase II is Rn7sk. Other abundant ncRNAs, like transfer RNAs and ribosomal RNAs, are highly modified; yet the modifications occurring in Rn7sk are largely unknown. In this proposal, I aim to investigate the Rn7sk RNA modification status and the impact of these modifications on neuronal cell fate and brain development. To accomplish this, I will; i) Characterize Rn7sk RNA modifications using a highly sensitive RNA mass spectrometry approach and evaluate the impact of selected modifications in recruiting protein binding partners using stable isotope labelling by amino acids in cell culture (SILAC) based mass spectrometry; ii) Determine the biological function of selected Rn7sk modifications during neuronal differentiation using genetically manipulated embryonic cell lines; iii) Investigate the role of Rn7sk during brain development using genome-wide sequencing technologies and a forebrain-specific Rn7sk knock-out mouse model. Results stemming from this project will reveal several novel aspects about how neuronal fate is controlled by tiny RNA modifications. My ultimate ambition is to establish my own laboratory and become an independent research leader in the field of Epitranscriptomics. This proposal, with the support from the experienced Prof Frye and the excellent host institute, DKFZ, is key for me to reach my goal.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2019

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

DEUTSCHES KREBSFORSCHUNGSZENTRUM HEIDELBERG
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 162 806,40
Adresse
IM NEUENHEIMER FELD 280
69120 Heidelberg
Deutschland

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Region
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 162 806,40
Mein Booklet 0 0