Description du projet
Plonger dans le microbiote des éponges mésophotiques
Les produits naturels ont inspiré la majorité des petites molécules actuellement autorisées pour des applications biomédicales. L’environnement marin constitue une source avérée de potentielles nouvelles molécules bioactives, mais la zone mésophotique, située entre 30 et 150 mètres sous la surface, fait l’objet d’études peu approfondies du fait de la difficulté technique à atteindre la zone crépusculaire des océans. Les éponges mésophotiques, sont ainsi relativement sous‑étudiées concernant leur potentiel en tant que produit naturel. Le projet COSMos, financé par l’UE, entend étudier de plus près les métagénomes des éponges mésophotiques; cette étude combinera de grandes analyses de données, des approches de biologie moléculaire et synthétique, et la bio‑informatique pour examiner le potentiel en tant que produit naturel de huit éponges mésophotiques privilégiées afin de découvrir de nouvelles molécules au potentiel médicinal.
Objectif
Molecules made by nature, or natural products, inspire the majority of currently approved small molecules for use in medicine. With an increase in widespread antibiotic resistance and the perpetual search for anticancer drugs, new sources of natural products must be discovered. The marine environment is a proven, prolific source of novel bioactive molecules and much of the ocean remains chemically and genetically unexplored. The mesophotic zone is particularly neglected because of the technological difficulty of reaching this twilight zone of the ocean. Shallow water marine sponges have been well documented to have diverse microbial populations and impressive chemical repertoires. Mesophotic sponges, however, are relatively unstudied in terms of their natural product potential. This project aims to take a deep dive into the metagenomes of mesophotic sponges for their natural product potential. Hybrid sequencing and assembly of metagenomes of eight prioritized sponges will uncover new biosynthetic gene clusters for heterologous expression and chemical elucidation. This study will combine large data analyses, cutting edge molecular and synthetic biology approaches and bioinformatic techniques to survey the natural product potential of mesophotic sponges and discover new molecules with medicinal potential.
Champ scientifique
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
6708 PB Wageningen
Pays-Bas