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Contenu archivé le 2024-05-29

Investigation of the functions of a novel protein, PRDM16, rearranged in cases of acute myeloid leukaemia with rare translocations

Objectif

The proposed research project plans to investigate the functions of a novel protein, PRDM16 (MEL1), in leukaemogenesis. PRDM16 is a member of the SET domain family of histone lysine methyltransferases and was recently identified by the host laboratory to be rearranged in three cases of acute myeloid leukaemia carrying rare translocations.

In the first case, full length PRDM16 is aberrantly expressed, whereas in the second case, a deleted PRDM16 lacking the SET domain (delPRDM16) is formed. In the third case, an AML1-PRDM16 fusion protein results. We plan to investigate how PRDM16, delPRDM16 and AML1-PRDM16 can give rise to AML. In particular we wish to investigate the importance of the SET domain, how fusion to AML1 alters the function of PRDM16, and whether AML1-PRDM16 can function in a similar way to AML1-ETO.

In vitro assays will initially be performed to investigate the biological phenotypes induced by each protein (PRDM16, delPRDM16, AML1-PRDM16 or AML1-ETO). The proteins will be over-expressed in murine haematopoietic progenitor cells (lin- cells) and will be assessed for their ability to block myeloid differentiation, increase survival upon genotoxic stress, and increase self-renewal.

In vivo assays will also be carried out to test the ability of the proteins to induce leukaemia in mice. In order to identify target genes commonly regulated by AML1-PRDM16 and AML1-ETO, Affymetrix gene expression microarrays will be employed. The proposed project will yield many important insights into the functions of PRDM16 and how its aberrant expression contributes to leukaemia.

The researcher has a background in mapping fusion genes in cancer and will therefore greatly expand her repertoire of laboratory skills by performing functional studies on a novel protein. The project will not only allow the researcher to become a highly skilled and independent scientist, but will make an important contribution to European cancer research.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinateur

EUROPEAN INSTITUTE OF ONCOLOGY (ISTITUTO EUROPEO DI ONCOLOGIA)
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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