Description du projet
L’évolution des modifications épigénétiques et leur rôle dans l’adaptation des espèces
Les modifications épigénétiques sont des modifications chimiques au niveau des histones et de l’ADN, qui jouent un rôle central dans la régulation de l’expression des gènes. On sait toutefois peu de choses sur la façon dont ces modifications changent au cours de l’évolution. Le projet DECAF, financé par l’UE, utilisera la méthylation de l’ADN comme modèle et étudiera les sites génétiques à méthylation stable dans le génome aviaire. Les scientifiques souhaitent également comprendre et déterminer les forces sélectives qui agissent sur la diversité de la méthylation de l’ADN dans les populations naturelles. Les résultats aideront à mettre en évidence le rôle des sites méthylés dans la différenciation des espèces et apporteront des informations sans précédent sur l’adaptation épigénétique.
Objectif
Epigenetics plays a fundamental role in the function and regulation of the genome. From an evolutionary viewpoint, a pressing question is whether epigenetic modifications are a source of adaptive variation. To answer this question substantial attention is being given to the epigenetic marks themselves, but surprisingly little is known about the evolutionary underpinnings of the genomic sites that anchor them. Using novel analytical and technical approaches, I want to address this fundamental knowledge gap. I will use the best understood epigenetic mark, DNA methylation, as a model and advance on recent findings in avian genome evolution, epigenetic inheritance and sequencing technology. This will enable me to pinpoint signatures of epigenetically driven adaptation. I have designed separate approaches at three different levels: (1) At the individual level, to identify stably methylated anchors in the avian germline with focus on a recently discovered germline-specific chromosome, (2) at the population level, to establish the selective forces acting on DNA methylation diversity in natural populations and (3) at the species level, to gain insight into how fast-mutating anchors of DNA methylation act as potential facilitators of species differentiation and barriers. Ultimately, by combining these three levels I will be able to pinpoint epigenetic anchors that are involved in molecular adaptation. The possible research outcomes will not only be valuable to evolutionary biologists and ecologists, but will also make fundamental contributions to molecular biology and possibly medical research, and will deepen our understanding of how epigenetic marks manifest themselves at the sequence level.
Champ scientifique
Mots‑clés
Programme(s)
Thème(s)
Régime de financement
ERC-STG - Starting GrantInstitution d’accueil
44227 Dortmund
Allemagne