Circular DNA-driven cancer genome remodeling

Información del proyecto

CancerCirculome

Identificador del acuerdo de subvención: 949172

DOI

10.3030/949172

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 8 Diciembre 2020

Fecha de inicio 1 Febrero 2021

Fecha de finalización 31 Enero 2026

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 498 888,00

Aportación de la UE

€ 1 498 888,00

Coordinado por

CHARITE - UNIVERSITAETSMEDIZIN BERLIN
Germany

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Publicaciones

Peer reviewed articles (8)

Defining the landscape of circular RNAs in neuroblastoma unveils a global suppressive function of MYCN

Autores: Steffen Fuchs, Clara Danßmann, Filippos Klironomos, Annika Winkler, Jörg Fallmann, Louisa-Marie Kruetzfeldt, Annabell Szymansky, Julian Naderi, Stephan H. Bernhart, Laura Grunewald, Konstantin Helmsauer, Elias Rodriguez-Fos, Marieluise Kirchner, Philipp Mertins, Kathy Astrahantseff, Christin Suenkel, Joern Toedling, Fabienne Meggetto, Marc Remke, Peter F. Stadler, Patrick Hundsdoerfer, Hedwig E.
Publicado en: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38747-4

Therapeutic targeting of ATR in alveolar rhabdomyosarcoma

Autores: Heathcliff Dorado García; Fabian Pusch; Yi Bei; Jennifer von Stebut; Glorymar Ibáñez; Kristina Guillan; Koshi Imami; Dennis Gürgen; Jana Rolff; Konstantin Helmsauer; Stephanie Meyer-Liesener; Natalie Timme; Victor Bardinet; Rocío Chamorro González; Ian C. MacArthur; Celine Y. Chen; Joachim Schulz; Antje M. Wengner; Christian Furth; Birgit Lala; Angelika Eggert; Georg Seifert; Patrick Hundsoe
Publicado en: Nature Communications, Edición 20411723, 2022, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32023-7

Parallel sequencing of extrachromosomal circular DNAs and transcriptomes in single cancer cells

Autores: Rocío Chamorro González, Thomas Conrad, Maja C. Stöber, Robin Xu, Mădălina Giurgiu, Elias Rodriguez-Fos, Katharina Kasack, Lotte Brückner, Eric van Leen, Konstantin Helmsauer, Heathcliff Dorado Garcia, Maria E. Stefanova, King L. Hung, Yi Bei, Karin Schmelz, Marco Lodrini, Stefan Mundlos, Howard Y. Chang, Hedwig E. Deubzer, Sascha Sauer, Angelika Eggert, Johannes H. Schulte, Roland F. Schwar
Publicado en: Nature Genetics, 2023, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-023-01386-y

Genetic elements promote retention of extrachromosomal DNA in cancer cells

Autores: Venkat Sankar, King L. Hung, Aditi Gnanasekar, Ivy Tsz-Lo Wong, Quanming Shi, Katerina Kraft, Matthew G. Jones, Britney Jiayu He, Xiaowei Yan, Julia A. Belk, Kevin J. Liu, Sangya Agarwal, Sean K. Wang, Anton G. Henssen, Paul S. Mischel, Howard Y. Chang
Publicado en: Nature, Edición 649, 2025, Página(s) 152-160, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09764-8

Extrachromosomal DNA–Driven Oncogene Dosage Heterogeneity Promotes Rapid Adaptation to Therapy in <i>MYCN</i> -Amplified Cancers

Autores: Giulia Montuori, Fengyu Tu, Di Qin, Rachel Schmargon, Elias Rodriguez-Fos, Konstantin Helmsauer, Hui Hui, Susmita Mandal, Karin Purshouse, Lara Fankhänel, Bartolomeo Bosco, Bastiaan Spanjaard, Hannah Seyboldt, Laura Grunewald, Matthias Jürgen Schmitt, Dennis Gürgen, Viktoria Buck, Mathias T. Rosenfeldt, Frank P.B. Dubois, Simon Schallenberg, Annika Lehmann, Jessica Theißen, Sabine Taschner-Man
Publicado en: Cancer Discovery, Edición 15, 2025, Página(s) 2054-2077, ISSN 2159-8274
Editor: American Association for Cancer Research Inc.
DOI: 10.1158/2159-8290.cd-24-1738

The evolutionary dynamics of extrachromosomal DNA in human cancers

Autores: Joshua T. Lange, John C. Rose, Celine Y. Chen, Yuriy Pichugin, Liangqi Xie, Jun Tang, King L. Hung, Kathryn E. Yost, Quanming Shi, Marcella L. Erb, Utkrisht Rajkumar, Sihan Wu, Sabine Taschner-Mandl, Marie Bernkopf, Charles Swanton, Zhe Liu, Weini Huang, Howard Y. Chang, Vineet Bafna, Anton G. Henssen, Benjamin Werner, Paul S. Mischel
Publicado en: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01177-x

Targeted profiling of human extrachromosomal DNA by CRISPR-CATCH

Autores: King L. Hung, Jens Luebeck, Siavash R. Dehkordi, Caterina I. Colón, Rui Li, Ivy Tsz-Lo Wong, Ceyda Coruh, Prashanthi Dharanipragada, Shirley H. Lomeli, Natasha E. Weiser, Gatien Moriceau, Xiao Zhang, Chris Bailey, Kathleen E. Houlahan, Wenting Yang, Rocío Chamorro González, Charles Swanton, Christina Curtis, Mariam Jamal-Hanjani, Anton G. Henssen, Julie A. Law, William J. Greenleaf, Roger S. Lo
Publicado en: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01190-0

ecDNA hubs drive cooperative intermolecular oncogene expression

Autores: King L. Hung, Kathryn E. Yost, Liangqi Xie, Quanming Shi, Konstantin Helmsauer, Jens Luebeck, Robert Schöpflin, Joshua T. Lange, Rocío Chamorro González, Natasha E. Weiser, Celine Chen, Maria E. Valieva, Ivy Tsz-Lo Wong, Sihan Wu, Siavash R. Dehkordi, Connor V. Duffy, Katerina Kraft, Jun Tang, Julia A. Belk, John C. Rose, M. Ryan Corces, Jeffrey M. Granja, Rui Li, Utkrisht Rajkumar, Jordan Frie
Publicado en: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-04116-8