Understanding collective mechanisms of cell fate regulation using single-cell genomics

Informations projet

AHH-OMICS

N° de convention de subvention: 950349

DOI

10.3030/950349

Date de signature de la CE 13 Novembre 2020

Date de début 1 Janvier 2021

Date de fin 31 Decembre 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 489 500,00

Contribution de l’UE

€ 1 489 500,00

Coordonné par

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (9)

Spatiotemporal Patterns of Active Epigenetic Turnover

Auteurs: Fabrizio Olmeda, Misha Gupta, Onurcan Bektas, Steffen Rulands
Publié dans: PRX Life, Numéro 4, 2026, ISSN 2835-8279
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/89bj-79g5

Clonal dynamics of surface-driven growing tissues

Auteurs: Ruslan I. Mukhamadiarov, Matteo Ciarchi, Fabrizio Olmeda, Steffen Rulands
Publié dans: Physical Review E, Numéro 109, 2024, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physreve.109.064407

Scaling and self-similarity in the formation of the embryonic epigenome

Auteurs: Fabrizio Olmeda, Tim Lohoff, Ioannis Kafetzopoulos, Stephen J. Clark, Laura Benson, Fatima Santos, Felix Krueger, Simon Walker, Wolf Reik, Steffen Rulands
Publié dans: Nature Physics, 2026, ISSN 1745-2473
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41567-026-03263-x

Transcriptional landscapes underlying Notch-induced lineage conversion and plasticity of mammary basal cells

Auteurs: Candice Merle, Calvin Rodrigues, Atefeh Pourkhalili Langeroudi, Robin Journot, Fabian Rost, Yiteng Dang, Steffen Rulands, Silvia Fre
Publié dans: The EMBO Journal, Numéro 44, 2025, Page(s) 2827-2855, ISSN 1460-2075
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44318-025-00424-1

Field theory of enzyme-substrate systems with restricted long-range interactions

Auteurs: Fabrizio Olmeda, Steffen Rulands
Publié dans: Physical Review E, Numéro 110(2), 2024, Page(s) 024404, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physreve.110.024404

FOXO1-mediated lipid metabolism maintains mammalian embryos in dormancy

Auteurs: Vera A. van der Weijden, Maximilian Stötzel, Dhanur P. Iyer, Beatrix Fauler, Elzbieta Gralinska, Mohammed Shahraz, David Meierhofer, Martin Vingron, Steffen Rulands, Theodore Alexandrov, Thorsten Mielke, Aydan Bulut-Karslioglu
Publié dans: Nature Cell Biology, Numéro 26, 2026, Page(s) 181-193, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-023-01325-3

Self-organization of plasticity and specialization in a primitively social insect.

Auteurs: Solenn Patalano; Adolfo Alsina; Carlos Gregorio-Rodríguez; Martin Bachman; Stephanie Dreier; Irene Hernando-Herraez; Paulin Nana; Shankar Balasubramanian; Seirian Sumner; Wolf Reik; Steffen Rulands
Publié dans: Cell Systems, Numéro 13(9), 2022, Page(s) 768-779.e4, ISSN 2405-4720
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cels.2022.08.002

scEpiAge: an age predictor highlighting single-cell ageing heterogeneity in mouse blood

Auteurs: Marc Jan Bonder, Stephen J. Clark, Felix Krueger, Siyuan Luo, João Agostinho de Sousa, Aida M. Hashtroud, Thomas M. Stubbs, Anne-Katrien Stark, Steffen Rulands, Oliver Stegle, Wolf Reik & Ferdinand von Meyenn
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-51833-5

Controlling noise with self-organized resetting

Auteurs: Felix J. Meigel, Steffen Rulands
Publié dans: Communications Physics, Numéro 8, 2025, ISSN 2399-3650
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42005-025-01985-7