Understanding (harmful) virus-host interactions by linking virology and bioinformatics

Información del proyecto

VIROINF

Identificador del acuerdo de subvención: 955974

DOI 10.3030/955974

Fecha de la firma de la CE 17 Agosto 2020

Fecha de inicio 1 Septiembre 2020

Fecha de finalización 31 Agosto 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total € 3 896 543,04

Aportación de la UE € 3 896 543,04

Coordinado por

FRIEDRICH-SCHILLER-UNIVERSITÄT JENA
Germany

Resultado final

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Publicaciones

Peer reviewed articles (4)

Antibiotic Exposure Leads to Reduced Phage Susceptibility in Vancomycin Intermediate Staphylococcus aureus (VISA)

Autores: Shawna McCallin; Carmen Menzi; Swenja Lassen; Jean Daraspe; Frank Oechslin; Philippe Moreillon
Publicado en: Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Edición Ahead of Print, 2022, ISSN 0066-4804
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aac.02247-21

Quantitative measures of within-host viral genetic diversity

Autores: Lara Fuhrmann; Kim Philipp Jablonski; Niko Beerenwinkel
Publicado en: Current opinion in virology, Edición 49, 2021, Página(s) 157-163, ISSN 1879-6257
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.3929/ethz-b-000493904

Sequential disruption of SPLASH-identified vRNA–vRNA interactions challenges their role in influenza A virus genome packaging

Autores: Celia Jakob, Gabriel L. Lovate, Daniel Desir, Lara Gießler, Redmond P. Smyth, Roland Marquet, Kevin Lamkiewicz, Manja Marz, Martin Schwemmle, and Hardin Bolte
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 51 (12), 2023, Página(s) 6479–6494, ISSN 1362-4962
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad442

The influenza A virus genome packaging network — complex, flexible and yet unsolved.

Autores: Celia Jakob; Rithu Paul-Stansilaus,; Martin Schwemmle; Roland Marquet; Hardin Bolte.
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 03051048, 2022, Página(s) 9023-9038, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac688

Other (3)

The International Virus Bioinformatics Meeting 2022

Autores: Franziska Hufsky; Denis Beslic; Dimitri Boeckaerts; Sebastian Duchene; Enrique González-Tortuero; Andreas J. Gruber; Jiarong Guo; Daan Jansen; John Juma; Kunaphas Kongkitimanon; Antoni Luque; Muriel Ritsch; Gabriel Lencioni Lovate; Luca Nishimura; Célia Pas; Esteban Domingo; Emma Hodcroft; Philippe Lemey; Matthew B. Sullivan; Friedemann Weber; Fernando González-Candelas; Sarah Krautwurst; Alba
Publicado en: Viruses, Edición 19994915, 2022, Página(s) 973, ISSN 1999-4915
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/v14050973

ITN—VIROINF: Understanding (Harmful) Virus-Host Interactions by Linking Virology and Bioinformatics

Autores: Winfried Goettsch; Niko Beerenwinkel; Li Deng; Lars Dölken; Bas E. Dutilh; Florian Erhard; Lars Kaderali; Max von Kleist; Roland Marquet; Jelle Matthijnssens; Shawna McCallin; Dino McMahon; Thomas Rattei; Ronald P. Van Rij; David L. Robertson; Martin Schwemmle; Noam Stern-Ginossar; Manja Marz
Publicado en: Viruses, Edición 13(5), 2021, Página(s) 766, ISSN 1999-4915
Editor: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.17169/refubium-30621

grandR: a comprehensive package for nucleotide conversion sequencing data analysis

Autores: Teresa Rummel; Lygeri Sakellaridi; Florian Erhard
Publicado en: bioRxiv, 2022
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.09.12.507665