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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS
Contenu archivé le 2024-04-15

RESEARCH AND DIFFUSION FOR A PORTABLE EUROPEAN SYSTEM OF ACCESS AND ANALYSIS OF BIOSEQUENCES

Objectif

THE LEARNING TECHNIQUES BASED SOFTWARE WILL ALLOW A MORE EFFICIENT AND USER FRIENDLY ANALYSIS OF DNA AND PROTEIN SEQUENCE DATA AND WILL FORM AN IMPORTANT TOOL IN PROTEIN ENGINEERING.
It is now established that software holds the key to the success or the failure of international sequencing projects. In this context, work is being carried out in order to create the tools to help biologists in the analysis of structure and functions of each gene or group of genes.
Research involves the conception and implementation in an intelligent workstation of a computing environment which handles biosequences: access to databases, access to sequence analysis and learning software, display of sequences and results, communications with other computers and laboratories.

The design of the architecture of the system, BIOSTATION, in flexible and evolutive modules is being developed. 3 versions were written for the 1-dimensional, 2-dimensional and 3-dimensional display of sequences and analysis results. Realization and test of a prototype was carried out on a personal computer (PC). Extensive use has been made of the database software ACNUC and a program, CLUSTAL, was written for aligning many sequences. Also, CLUSTAL, portability of the system in OS/2 and UNIX operating systems have been linked.

A working methodology in design and realization of software for the computing of genomic sequence and the study of protein folding have been achieved. The first industrial exploitation of this work will be the diffusion of a commercial version BIOSTATION by a European company, GENOMIC, in 1991. A multiple sequence aligment program, CLUSTAL, was designed for microcomputer use. CLUSTAL is capable of aligning up to 100 sequences of 1200 residues each. This software has been distributed to 150 locations worldwide.
APPLICATION OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE TECHNIQUES FOR THE PREDICTION OF MACROMOLECULE FUNCTIONS.
DEVELOPMENT OF TOOLS ALLOWING THE DECODING OF INFORMATION IN BIOLOGICAL SEQUENCES. TWO APPROACHES ARE PROPOSED FOR DEVELOPMENT.:

-SOFTWARE FOR THE ANALYSIS OF SEQUENCES USING LEARNING TECHNIQUES.
-AN INTERFACE ALLOWING BIOLOGISTS TO USE THE RULES IN THE ABOVE SOFTWARE. THESE RULES ARE USED TO CONSTRUCT PEPTIDE OR DNA SEQUENCES WITH A GIVEN FUNCTION.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Données non disponibles

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

Données non disponibles

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

CSC - Cost-sharing contracts

Coordinateur

Université de Montpellier II (Université des Sciences et Techniques du Languedoc)
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Adresse
Rue de Saint Priest
34100 Montpellier
France

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Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Participants (1)

Mon livret 0 0