Objetivo
THE CENTRE FOR BIO-INFORMATICS WILL PROVIDE AN ESSENTIAL SERVICE IN THE FIELD OF NUCLEIC ACID AND PROTEIN SEQUENCE DATABASE ANALYSIS FOR THE WHOLE BIOTECHNOLOGY COMMUNITY IN IRELAND. BOTH ACADEMIC AND INDUSTRIAL RESEARCH WILL BENEFIT FROM THIS SERVICE.
It is now established that software holds the key to the success or the failure of international sequencing projects. In this context, work is being carried out in order to create the tools to help biologists in the analysis of structure and functions of each gene or group of genes.
Research involves the conception and implementation in an intelligent workstation of a computing environment which handles biosequences: access to databases, access to sequence analysis and learning software, display of sequences and results, communications with other computers and laboratories.
The design of the architecture of the system, BIOSTATION, in flexible and evolutive modules is being developed. 3 versions were written for the 1-dimensional, 2-dimensional and 3-dimensional display of sequences and analysis results. Realization and test of a prototype was carried out on a personal computer (PC). Extensive use has been made of the database software ACNUC and a program, CLUSTAL, was written for aligning many sequences. Also, CLUSTAL, portability of the system in OS/2 and UNIX operating systems have been linked.
A working methodology in design and realization of software for the computing of genomic sequence and the study of protein folding have been achieved. The first industrial exploitation of this work will be the diffusion of a commercial version BIOSTATION by a European company, GENOMIC, in 1991. A multiple sequence aligment program, CLUSTAL, was designed for microcomputer use. CLUSTAL is capable of aligning up to 100 sequences of 1200 residues each. This software has been distributed to 150 locations worldwide.
AN ONLINE NUCLEIC ACID AND PROTEIN
EXPECTED BENEFITS
THE SEQUENCE DATABASE ANALYSIS SERVICE WILL BE DEVELOPED. THE INITIAL BASIS WILL BE THE ACNUC DATABASE AND RETRIEVAL SYSTEM. THE QUALITY OF THE SERVICE WILL BE OPTIMIZED BY MAXIMISING (1) THE ACCESSIBILITY, AND (2) THE APPROPRIATENESS OF SOFTWARE.
POINTS (1) AND (2) WILL INVOLVE VERY FREQUENT INTERACTION BETWEEN THE STAFF OF THE CENTRE FOR BIO-INFORMATICS AND PROSPECTIVE USERS OF THAT CENTRE.
POINT (1) WILL ALSO INVOLVE TRAINING OF END-USERS, AND REQUESTS FOR PERCEIVED DIFFICULTIES IN USE.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información software software de aplicación software de sistemas sistema operativo
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas ácido nucleico
- ciencias naturales informática y ciencias de la información base de datos
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas plegamiento de proteínas
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Datos no disponibles
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
DUBLIN 2
Irlanda
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.