Objectif
The ImMunoGeneTics database, IMGT, is an integrated specialised database containing nucleotide sequence information of genes important in the function of the immune system. It collects and annotates sequences belonging to the immunoglobulin superfamily which are involved in immune recognition, these are the Immunoglobulins (Ig), the T cell antigen receptors (TcR) (LIGM-DB) and the Major Histocompatibility Complex (MHC). In humans, the latter are referred to as the Human Leucocyte Antigens (HLA) system (HLA-DB). Collection and analysis of such sequences is important for the understanding of disorders of the immune system such as infectious diseases, autoimmunity, allergy or tumour development, and for the development of antibody engineering, transplantation and immunotherapy.
IMGT works in close collaboration with the EMBL database and uses sequence information from the EMBL database for expert annotation. As the EMBL database is a generalist database, it collects sequences of all types from all species, there are insufficient resources for specialised information to be added. In IMGT however such information is added in a consistent and standardised way by expert annotators. This annotation procedure includes verification of the sequence data by homology studies using multiple sequence alignment tools, and also labelling of the sequence, which cannot be carried out at the generalist databanks. By updating the information held at the generalist databases from the specialist databases, the quality of the information will improve. This project requests support for the European partners involved in the expansion phase of the IMGT database. LIGM (France): project coordinator, responsible for the IMGT database design and structure, software development for sequence annotation and multiple alignments, annotation of TcR and Ig sequences, and integration of genetic mapping data in IMGT. EMBL-EBI (UK): IMGT database integration, interfacing with the EMBL database, database development and distribution, network interfacing and protein specific annotations for IMGT- TREMBL. ICRF (UK) and BPRC (The Netherlands) collection and annotation of HLA sequences and other MHC encoded genes, generation of alignment tables, and database development. IFG (Germany): software development for multiple sequence alignments and fast sequence searching, development of alignment tables, annotation of Ig sequences. EUROGENTEC (Belgium): constitution of an oligonucleotide primer database, application tools for fundamental, pharmaceutical and clinical purposes. The aims at the end of the 3 year project are to set up efficient IMGT sequence submission tools at EMBL-EBI, so that the authors are able to provide annotations themselves, to establish a permanent structure at LIGM and EMBL-EBI for the quality control, data distribution, and further IMGT development, to establish freely available common data access to all immunogenetics data and to provide a graphical user friendly data access. Europe has taken a lead in the development of an integrated database which is unique in the world. The data distribution are at the forefronts of technology. By management of the enormous complexity of the immunogenetics data, IMGT will be of immense value for Biology, Biotechnology, Medicine as well as for the European Pharmaceutical Industry, and will considerably help to strenghten Europe's role in these areas.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles informatique et science de l'information bases de données
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles informatique et science de l'information logiciel développement logiciel
- sciences naturelles sciences biologiques génétique nucléotide
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Nous sommes désolés... Une erreur inattendue s’est produite.
Vous devez être authentifié. Votre session a peut-être expiré.
Merci pour votre retour d'information. Vous recevrez bientôt un courriel confirmant la soumission. Si vous avez choisi d'être informé de l'état de la déclaration, vous serez également contacté lorsque celui-ci évoluera.
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
34293 MONTPELLIER
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.