Objectif
This project is based on the observation that the electrophoresis step in sequencing is a major bottleneck and a considerable financial burden of the genome biomedical project. It is aimed at constructing a prototype capillary array sequencer with significantly increased output and decreased operation cost, as compared with slab-gel sequencers. Capillary electrophoresis combines the following advantages as compared with slab-gels : - Capability of sustaining higher field strengths, leading to shorter separation times
- Easty automation of separation matrix replacement and sample loading
- Miniaturization, allowing a larger number of samples to be studied.
The project focuses on low operation cost, high automation and robustness for routine operation. It will include in particular the evaluation and optional integration in the prototype of the following innovative approaches:
- The synthesis of new acrylamido monomers, yielding sieving matrices with longer lifetime and better resistance to hydrolysis
- A new family of sieving matrices based on amphiphilic polymer solutions that can be switched from liquid-like behaviour (for automated replacement of used sieving medium) to gel-like behaviour (for good separation properties)
- The development and evaluation of new reporter chemistry schemes yielding a better signal/noise ratio, in particular energy-transfer dyes and lanthanide complexes
- The use of pulsed-field capillary electrophoresis to increase the size range separable
- A new technology for mass production of very low cost capillary arrays
- An original detection scheme based on imaging techniques.
The project is a continuation in part of project n BMH4-CT96-1158, Capillary Array DNA Sequencing, called CADS I in the following for the sake of terseness. This project received only partial financing, so that it was decided to reduce its duration to two years, and its scope to an exploration of the different technological alternatives on small-scale prototypes. The aim of this second project is to use the information gathered by CADS I, to build an upgraded 96-capillary array for routine DNA sequencing.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences sociales sociologie relations industrielles automatisation
- sciences naturelles sciences chimiques science des polymères
- sciences naturelles sciences chimiques électrochimie électrophorèse
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
75231 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.