Objetivo
Research objectives and content
Titin is a giant protein of vertebrate striated muscles. Titin has a molecular weight of 3,000 kDa, and is the largest known protein. Single titin molecules are more than I mum long, and form a filament system which links the Z-discs to the M-lines. Little is known about the interactions that integrate the titin filament into the sarcomere. My first objective is to perform a covering search for ligands of the titin filament by the yeast two-hybrid approach. Identified clones that possibly interact with the titin will be sequenced and expressed in E. coli. Proteinbiochemical studies will test which clones are indeed titin-binding proteins, and will allow a fine-mapping of the interacting domains. The titin filament also contains domains of presumably regulatory functions such as calpain protease binding domains, and a kinase domain. Possibly, novel insight into the muscle physiology and pathophysiology of striated muscle will be obtained by the study of factors which interact with titin's regulatory elements. My second objective will be to test the functions of the novel titin ligands. I will express the identified titin ligands transiently in myocytes, and characterize in detail the functional consequences of this on the myogenesis, and on sarcomeric assembly.
Training content (objective, benefit and expected impact)
The team I will join is internationally leading in titin research and is well-integrated into a network of international collaborations. My PhD project will introduce me to techniques for expressing protein domains in a variety of heterologous overexpression systems (yeast, E. coli, mammalian cells). I will purify identified domains to homogeneity, and thereby obtain a thorough training in proteinbiochemical methods. The study of the interaction of titin and titin ligand domains will use modern methods of evaluating protein/protein interactions in vivo and in vitro. I expect to publish relevant findings in internationally well known and peer-reviewed journals, and to obtain my PhD from EMBL.
Links with industry / industrial relevance (22)
My master thesis project was carried out in the company, Novo Nordisk A/S, which is internationally engaged in molecular diagnostics. Therefore, I have already obtained some insight into how biotechnology applications are relevant to industry. My PhD project will give me a thorough training in modern molecular biology, which at a later stage may make me able to establish myself in the general field of biotechnology and molecular medicine, possibly in a sector which links basic and applied research.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias médicas y de la salud medicina básica fisiología fisiopatología
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
69012 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.