Obiettivo
Research objectives and content
Titin is a giant protein of vertebrate striated muscles. Titin has a molecular weight of 3,000 kDa, and is the largest known protein. Single titin molecules are more than I mum long, and form a filament system which links the Z-discs to the M-lines. Little is known about the interactions that integrate the titin filament into the sarcomere. My first objective is to perform a covering search for ligands of the titin filament by the yeast two-hybrid approach. Identified clones that possibly interact with the titin will be sequenced and expressed in E. coli. Proteinbiochemical studies will test which clones are indeed titin-binding proteins, and will allow a fine-mapping of the interacting domains. The titin filament also contains domains of presumably regulatory functions such as calpain protease binding domains, and a kinase domain. Possibly, novel insight into the muscle physiology and pathophysiology of striated muscle will be obtained by the study of factors which interact with titin's regulatory elements. My second objective will be to test the functions of the novel titin ligands. I will express the identified titin ligands transiently in myocytes, and characterize in detail the functional consequences of this on the myogenesis, and on sarcomeric assembly.
Training content (objective, benefit and expected impact)
The team I will join is internationally leading in titin research and is well-integrated into a network of international collaborations. My PhD project will introduce me to techniques for expressing protein domains in a variety of heterologous overexpression systems (yeast, E. coli, mammalian cells). I will purify identified domains to homogeneity, and thereby obtain a thorough training in proteinbiochemical methods. The study of the interaction of titin and titin ligand domains will use modern methods of evaluating protein/protein interactions in vivo and in vitro. I expect to publish relevant findings in internationally well known and peer-reviewed journals, and to obtain my PhD from EMBL.
Links with industry / industrial relevance (22)
My master thesis project was carried out in the company, Novo Nordisk A/S, which is internationally engaged in molecular diagnostics. Therefore, I have already obtained some insight into how biotechnology applications are relevant to industry. My PhD project will give me a thorough training in modern molecular biology, which at a later stage may make me able to establish myself in the general field of biotechnology and molecular medicine, possibly in a sector which links basic and applied research.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze mediche e della salute medicina di base fisiologia fisiopatologia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche biologia molecolare
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
69012 Heidelberg
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.