Objectif
Research objectives and content
The objective of my research project is the directed evolution of an alpha/beta-barrel protein to create a new catalytic activity on the existing scaffold. The aim then is to characterise both the intermediate and the final proteins identified during the directed evolution process using both functional and structural probes. This will give a unique insight at a molecular level into the way a protein evolves in response to a selective pressure, and into how the changes in function correlate with changes in structure.
The project will involve creation and expression of libraries of the alpha/beta-barrel protein indoleglycerolphosphate synthase in appropriate strains of E. coli. Mutation of the cloned wild-type gene in both a targeted and random manner will be followed by selection for the ability to complement suitable auxotrophic strains of E. coli. Iteration of this process in combination with 'DNA shuffling' will be used to identify new variants with improved activity. Selected proteins isolated will be over-expressed, purified and used for crystallisation experiments. If crystals are obtained, I will undertake to solve the structures by x-ray crystallography; this should be greatly simplified by use of molecular replacement methods since the wild-type structure has been solved previously at high resolution.
Training content (objective, benefit and expected impact)
My project will be part of a research programme for a postgraduate degree from Cambridge University, and it will provide advanced scientific training for a career in molecular and structural biology. My project will be co-supervised by two members of the academic staff in the Biochemistry Department and I will benefit greatly from the environment since I will join two experienced research groups. These groups will between them provide access to facilities for molecular biology, display technologies, enzymology, preparative biochemistry, computation and x-ray data collection, and I will gain experience in each of these. The research groups will also provide specialised reagents needed for my project. Links with industry / industrial relevance (22)
At the onset, there are no industrial links, but the results will quite possibly have application in a rational and generic approach to the design of novel enzymes. This would be of potential significance in both the pharmaceuticals industry and directly in medicine. Proteins with novel catalytic activities might be used in the synthesis of new drugs or, in vivo, for intracellular hydrolysis of prodrugs, thus increasing the specificity of such therapy. In an extracellular environment, enzymes with modified activities could be used in diagnostics and even to intervene with accessible disease states.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géologie minéralogie cristallographie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire biologie structurale
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
CB2 2QR Cambridge
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.