Objectif
Research objectives and content
The interest of this research work is directed to study DNA polymers and oligomers containing A-T base pairs by X-ray diffraction. The two main objectives consist in determining the structure of A-T rich regions in DNA double helices and in understanding the interaction of these DNA sequences with basic proteins. This alternating sequence is also essential for DNA trascription, since it is the essential element of the TATA box. This project aims to understand further the versatility of (TA)n sequences, in particular when they interact with non-specific proteins such as protamines and histones.
The first part of the research work consists in searching the D form of the following sequences by single crystal X-ray diffraction; trying to find adequate crys-allization conditions, which should promote the D form. The second part consists in co-crystallizing these fragments with basic peptides. The peptide sequences are consensus sequences of histone Hl and some basic sperm proteins.
Besides this, the CGTATATACG refinament structure represents another important objective in a short time.
Training content (objective, benefit and expected impact)
Objective: To obtain the Ph.D degree; Benefit: To learn Macromolecular Crystallography; Expected Impact: Find new structures of DNA, improving knowledge about relation between topology and function.
Links with industry / industrial relevance (22)
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géologie minéralogie cristallographie
- sciences naturelles mathématiques mathématiques pures topologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences chimiques science des polymères
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
08028 BARCELONA
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.