Objectif
Research objectives and content:
Human KRAB zinc finger proteins (KRAB ZFPs) represent a large subfamily of ZFPs of the Kruppel Cys2His2 (C2H2)-type containing a Krueppel associated box (KRAB) domain in their amino termini. Based on the finding that the KRAB domain can silence transcription when fused to a heterologous DNA binding domain in transiently transfected mammalian cells, the KRAB ZFPs have been postulated to function as negative regulators of transcription in many levels of cellular growth and differentiation. However, there is also the possibility that they participate in more general functions concerning structure and organisation of chromosomes. Recently, two specific KRAB-interacting proteins have been identified and characterized: TIF1alpha and TIF1a, which both belong to the same gene family and
have many of the properties expected for corepressors acting at the chromatin level. TIF1alpha but not TIF1a was shown to interact directly with the ligand-dependent transcriptional activation function AF2 of nuclear receptors (NRs), indicating that some members of the TIF1 gene family may play a dual role in transcription, being involved in both repression by KRAB ZFPs and reactivation by agonist-bound NRs The aim of this project is to address the biological significance of the KRAB ZFP-TIF1 and TIF1-NR interactions.
Training content:
We will performed a yeast two hybrid screen using the KRAB-interacting domains of TIFlalpha and TIF1a as individual baits and a mouse embryo cDNA expression library. By this approach, mouse cDNAs
encoding KRAB ZFPs that interact specifically with TIF1alpha and/or TIF1a will be identified and characterized.
The corresponding genomic DNAs will be isolated for the
subsequent disruption of the individual genes in mouse. The consequence(s) of these null mutations on development, cell differentiation and gene induction by nuclear receptors will be investigated. In addition, an in vitro transcription and chromatin assembly system that supports KRAB-mediated repression will be established and investigated for hormone-dependent reactivation.
Links with industry/industrial relevance:
We expect the project to result in the identification of new genes encoding regulatory proteins, some of which might be associated with specific human diseases. Therefore, the project will provide the basis for the development of new diagnostic and therapeutic concepts.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences chimiques chimie inorganique métal de transition
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences médicales et de la santé médecine clinique embryologie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
67404 ILLKIRCH GRAFFENSTADEN
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.