Objectif
Research objectives and content The recent genome sequences of several species of archaea indicate the presence of a eukaryotic-type replication 'machinery' in this third domain of life. However, our knowledge about the details of DNA replication in hyperthermophilic archaea is currently limited to the identification of a few putative replication proteins in the genome sequences available, and consequently we propose to initiate a systematic and broad study on mechanistic details of DNA replication in these extremophiles. Using biochemical and molecular biological means, we wish to investigate and identify previously unidentified archaeal replication factors. Their identification should be informative to further our understanding of DNA replication also in eukaryotic systems. We also might be able to identify unique proteins of commercial value that could be used to improve the processivity or fidelity of thermostable DNA polymerases routinely used in PCR applications. Using the plasmid isolated in Dr. Forterre's research group fromPyrococcus abyssii, in vitro assay(s) for hypertherrnophilic primase activity will be established. A yeast two-hybrid system will be used to extensively screen for proteins interacting with the known components of an archaeal replication fork. In addition, in collaboration with Genescope (French National Sequencing center), we will search for additional DNA replication factors in the genome sequence of Pyrococcus abyssii .
Training content (objective, benefit and expected impact)
The host laboratory is an ideal place for the proposed experiments due to the availability of the highly specialised equipment necessary for cultivation of Pyrococcus species as well as the presence of several scientists with the deep knowledge and interest on DNA replication. Optimally, my stay in Orsay will open new doors to studies on DNA replication, and will help to establish myself as an independent scientist. Links with industry / industrial relevance (22)
Dr. Forterre's research group is in contact with European Industries through the Industrial platform of the EC project 'Extremophiles as cell factory'. In addition, we have contacted Finozymes Oy in Espoo, Finland (see the enclosed fax) with the regards of PCR applications for our novel proteins discovered during this project.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
91405 GOMETZ LA VILLE
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.