Ziel
Research objectives and content The recent genome sequences of several species of archaea indicate the presence of a eukaryotic-type replication 'machinery' in this third domain of life. However, our knowledge about the details of DNA replication in hyperthermophilic archaea is currently limited to the identification of a few putative replication proteins in the genome sequences available, and consequently we propose to initiate a systematic and broad study on mechanistic details of DNA replication in these extremophiles. Using biochemical and molecular biological means, we wish to investigate and identify previously unidentified archaeal replication factors. Their identification should be informative to further our understanding of DNA replication also in eukaryotic systems. We also might be able to identify unique proteins of commercial value that could be used to improve the processivity or fidelity of thermostable DNA polymerases routinely used in PCR applications. Using the plasmid isolated in Dr. Forterre's research group fromPyrococcus abyssii, in vitro assay(s) for hypertherrnophilic primase activity will be established. A yeast two-hybrid system will be used to extensively screen for proteins interacting with the known components of an archaeal replication fork. In addition, in collaboration with Genescope (French National Sequencing center), we will search for additional DNA replication factors in the genome sequence of Pyrococcus abyssii .
Training content (objective, benefit and expected impact)
The host laboratory is an ideal place for the proposed experiments due to the availability of the highly specialised equipment necessary for cultivation of Pyrococcus species as well as the presence of several scientists with the deep knowledge and interest on DNA replication. Optimally, my stay in Orsay will open new doors to studies on DNA replication, and will help to establish myself as an independent scientist. Links with industry / industrial relevance (22)
Dr. Forterre's research group is in contact with European Industries through the Industrial platform of the EC project 'Extremophiles as cell factory'. In addition, we have contacted Finozymes Oy in Espoo, Finland (see the enclosed fax) with the regards of PCR applications for our novel proteins discovered during this project.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Daten nicht verfügbar
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
91405 GOMETZ LA VILLE
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.