Objectif
Research objectives and content
In this project a new nuclear magnetic resonance (NMR) method will be developed in order to obtain structural constraints for two types of dihedral angles, currently undeterminable, that define the conformation around the phosphate group in RNA. Recently, a new generation of constraints have been proposed by the host laboratory (Reif, B. et al. Science, 276 1230-1233, 1997) that allow, in a very elegant way, to achieve additional structural information in proteins from cross-correlated relaxation rates. Inspired by this idea, cross-correlated relaxation of 13C, 31p heteronuclear zero quantum (ZQ) and double quantum (DQ) coherence will be exploited to determine the conformation of the phophodiester group in oligonucleotides.
Training content (objective, benefit and expected impact)
By developing the proposed methodology, based on the measurement of cross-correlation rates, the candidate will deepen her knowledge this field of solution NMR. In addition, she will learn solid state NMR, since both techniques are essential to achieve the goals of this project and she will study for the first time RNA molecules. Phosphate groups tend to break down the network of distance and angle constraints available from NMR. The method we propose is designed to fill this gap by providing
non-conventional constraints for two angles, currently undeterminable, defining the phosphodiester conformation.
Links with industry / industrial relevance (22)
None for the project, according to point (22)
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
60439 FRANKFURT AM-MAIN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.