Obiettivo
Research objectives and content
In this project a new nuclear magnetic resonance (NMR) method will be developed in order to obtain structural constraints for two types of dihedral angles, currently undeterminable, that define the conformation around the phosphate group in RNA. Recently, a new generation of constraints have been proposed by the host laboratory (Reif, B. et al. Science, 276 1230-1233, 1997) that allow, in a very elegant way, to achieve additional structural information in proteins from cross-correlated relaxation rates. Inspired by this idea, cross-correlated relaxation of 13C, 31p heteronuclear zero quantum (ZQ) and double quantum (DQ) coherence will be exploited to determine the conformation of the phophodiester group in oligonucleotides.
Training content (objective, benefit and expected impact)
By developing the proposed methodology, based on the measurement of cross-correlation rates, the candidate will deepen her knowledge this field of solution NMR. In addition, she will learn solid state NMR, since both techniques are essential to achieve the goals of this project and she will study for the first time RNA molecules. Phosphate groups tend to break down the network of distance and angle constraints available from NMR. The method we propose is designed to fill this gap by providing
non-conventional constraints for two angles, currently undeterminable, defining the phosphodiester conformation.
Links with industry / industrial relevance (22)
None for the project, according to point (22)
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
60439 FRANKFURT AM-MAIN
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.