Objetivo
Plant disease resistance (R) genes are key components in pathogen perception; R genes activate a battery of responses, and the recognition by R genes is hypothesized to be upstream of a signal transduction pathway. A cDNA-AFLP analysis resulted in the identification of ~ 150 Avr9/Cf-9 rapidly elicited (ACRE) genes. These ACRE genes became rapidly induced or repressed within 30' upon elicitation of a Cf-9 (R) tobacco cell culture. In addition to known signal transduction components ACRE genes code for putative components of the E3 ligase complexes, such as RING-H2 finger proteins, U box, and F box proteins components of the SCF complexes. E3 ligases complexes play a critical role in the selection of substrates for proteolysis. Selected substrates become 'tagged' with Ubiquitin, which targets them to the 26S proteasome. The specific substrates for each E3 ligase are expected to be negative regulators of the plant defense responses. The aim of this project will be to identify the substrates of the identified F-boxes, which seem to specifically recognise phosporylated substrates. Ubiquitination is a novel aspect in plant defense responses and it probablyplays a larger role in plants than in other organisms. Epitipe-tagged versions of the U boxes will facilitate in the identification of the putative interactors. Subsequently, an in-depth biochemical study will reconfirm the putative interactions. Finally, we will obtain a protein-protein interaction map for the identified E3 ligase complexes. The aim is to unravel the role of ubiquitination in plant defense responses. The proposed technique for the purification of protein complexes will require a substantial biochemical optimization to obtain intact E3 ligase protein complexes. Putative interactors will be identified by mass spectrometry, which is a novel aspect in the Jones Lab. Interactions need to be reconfirmed by yeast-to-hybrid screens and immuno-precipitation. This proposal is imbedded in a larger initiative on the role of ubiquitination in plants defence signalling at the Sainsbury laboratory. The Sainsbury laboratory is an excellent environment for this project as it hosts an extensive group of experienced researchers. A wide experience is available with most proposed techniques and model systems. Conclusively, I will get excellent biochemical training while I will be involved in a project at the frontier of biochemical possibilities and novel aspects of plant defence signalling.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias químicas química analítica espectrometría de masas
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Datos no disponibles
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
NR47UH NORWICH
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.