Obiettivo
Plant disease resistance (R) genes are key components in pathogen perception; R genes activate a battery of responses, and the recognition by R genes is hypothesized to be upstream of a signal transduction pathway. A cDNA-AFLP analysis resulted in the identification of ~ 150 Avr9/Cf-9 rapidly elicited (ACRE) genes. These ACRE genes became rapidly induced or repressed within 30' upon elicitation of a Cf-9 (R) tobacco cell culture. In addition to known signal transduction components ACRE genes code for putative components of the E3 ligase complexes, such as RING-H2 finger proteins, U box, and F box proteins components of the SCF complexes. E3 ligases complexes play a critical role in the selection of substrates for proteolysis. Selected substrates become 'tagged' with Ubiquitin, which targets them to the 26S proteasome. The specific substrates for each E3 ligase are expected to be negative regulators of the plant defense responses. The aim of this project will be to identify the substrates of the identified F-boxes, which seem to specifically recognise phosporylated substrates. Ubiquitination is a novel aspect in plant defense responses and it probablyplays a larger role in plants than in other organisms. Epitipe-tagged versions of the U boxes will facilitate in the identification of the putative interactors. Subsequently, an in-depth biochemical study will reconfirm the putative interactions. Finally, we will obtain a protein-protein interaction map for the identified E3 ligase complexes. The aim is to unravel the role of ubiquitination in plant defense responses. The proposed technique for the purification of protein complexes will require a substantial biochemical optimization to obtain intact E3 ligase protein complexes. Putative interactors will be identified by mass spectrometry, which is a novel aspect in the Jones Lab. Interactions need to be reconfirmed by yeast-to-hybrid screens and immuno-precipitation. This proposal is imbedded in a larger initiative on the role of ubiquitination in plants defence signalling at the Sainsbury laboratory. The Sainsbury laboratory is an excellent environment for this project as it hosts an extensive group of experienced researchers. A wide experience is available with most proposed techniques and model systems. Conclusively, I will get excellent biochemical training while I will be involved in a project at the frontier of biochemical possibilities and novel aspects of plant defence signalling.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze chimiche chimica analitica spettrometria di massa
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Dati non disponibili
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
NR47UH NORWICH
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.