Objectif
One of the challenging tasks given by the arrival of a complete genome is the detection of the genomic regions undergoing weak selection. This can only be done by comparative sequence analysis using bioinformatics tools to recover, store and analyze genomic data. According to population genetics models, the efficacy of natural selection is expected to vary with the recombination rate. The study of the impact of the recombination rate variations on the evolution of DNA sequences is thus required to detect regions undergoing weak selection. However, as we showed during my PhD, recombination has other neutral (= non selective) effects that could interfere with its role on selection efficacy. I propose to reevaluate the existent models of the recombination effects on genome evolution by taking into account these neutral effects. The modified models will then be tested with available genomic data from Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans and Arabidopsis thaliana. This project involves bioinformatics, statistics and modeling approaches aimed at integrating and quantifying the effects of recombination on genome evolution. The scientific environment of the Charles worth's group is particularly adapted to this goal because they have a strong interest and experience on these topics. This will allow me to get population genetics skills in order to complement the genomic data analysis skills that I acquired during my PhD. For the host group, this will be the opportunity to get bioinformatics tools coming from the French group where I did my PhD. This will also allow fruitful scientific exchanges since applicant and host have different views about the effects of recombination on genome evolution.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information science des données
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome génome eucaryote
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Données non disponibles
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
EH9 3JT EDINBURGH
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.