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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-05-21

Detecting weak selection in eukaryotic genomes: effects of recombination rate

Ziel

One of the challenging tasks given by the arrival of a complete genome is the detection of the genomic regions undergoing weak selection. This can only be done by comparative sequence analysis using bioinformatics tools to recover, store and analyze genomic data. According to population genetics models, the efficacy of natural selection is expected to vary with the recombination rate. The study of the impact of the recombination rate variations on the evolution of DNA sequences is thus required to detect regions undergoing weak selection. However, as we showed during my PhD, recombination has other neutral (= non selective) effects that could interfere with its role on selection efficacy. I propose to reevaluate the existent models of the recombination effects on genome evolution by taking into account these neutral effects. The modified models will then be tested with available genomic data from Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans and Arabidopsis thaliana. This project involves bioinformatics, statistics and modeling approaches aimed at integrating and quantifying the effects of recombination on genome evolution. The scientific environment of the Charles worth's group is particularly adapted to this goal because they have a strong interest and experience on these topics. This will allow me to get population genetics skills in order to complement the genomic data analysis skills that I acquired during my PhD. For the host group, this will be the opportunity to get bioinformatics tools coming from the French group where I did my PhD. This will also allow fruitful scientific exchanges since applicant and host have different views about the effects of recombination on genome evolution.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Daten nicht verfügbar

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

Daten nicht verfügbar

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

RGI - Research grants (individual fellowships)

Koordinator

UNIVERSITY OF EDINBURGH
EU-Beitrag
Keine Daten
Adresse
West Mains Road, Ashworth Laboratories, King's Bu
EH9 3JT EDINBURGH
Vereinigtes Königreich

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Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
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