Objetivo
Linkage-disequilibrium (LD) mapping as a powerful tool for fine-mapping disease genes, the TSC have committed to produce a complete haplotype map of the human genome to enable large-scale LD mapping studies. The availability of this data set, calls for a unified tool for visualization of this haplotype data in the full genomic context, e.g. in relation to other SNPs, genes and other genomic information. No tools currently address the specific need to visualize haplotype data. This project proposes to develop tools to allow visualization and mining of haplotype data sets using Ensembl, a public genome visualization tool. All code generated, as part of this project will be contributed back to the public Ensembl project, in close collaboration with scientists at the EBI. In addition to developing tools to visualize haplotype data, we also propose to use the whole genome haplotype data set to perform a series of whole genome analyses to investigate the relationship between LD and physical and sequence-based properties of the genome. Large-scale genome analysis may be very informative, with a haplotype map as a reference it may be possible to estimate the extent of LD in a region based purely on human genome data, this ability may significantly enhance disease gene discovery. GSK bioinformatics has very substantial resources that will be fully available for use by the fellow. This includes access to modern powerful computing hardware suitable for studies of this scale. In addition to the academic and scientific aspects of this post. the fellow will have substantial personal development opportunities with full access to GSK training courses on IT skills, team working and personal development.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Datos no disponibles
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
TW8 9GS BRENTFORD
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.