Objectif
The rat is a useful and sometimes unique model for the study of many physiological traits and diseases.
In contrast to its central role in physiology, biochemistry, toxicology, transplantation research, cancer research, neurobiology and other fields, the rat has lagged behind the mouse as a genetic model organism. Molecular biology has catalysed the convergence of physiology and genetics, and consequently there is an increasing need for genetic studies in the rat. In the past few years there has been very significant progress in rat genome analysis. While almost no reliable gene assignment was available in the early 80'es, some 600 rat genes have now been assigned to specific chromosomes, and a genetic map with some 650 markers is also available. Teams participating in the present project have been intimately involved in this development, contributing about half of the chromosome assignments and also to the construction of the linkage maps. Furthermore, the participating teams have developed the only existing international rat genetic database (RATMAP). Thus European teams have a strong tradition in rat gene mapping, and our proposal is to generate mapping resources and information necessary to take advantage of the rat for the identification of genes underlying traits relevant to mammalian physiology, behaviour and complex disease, such as diabetes, hypertension, susceptibility to cancer or stress, drug addiction etc.
The genetic basis of such traits could be understood if the rat genome was better known.
The proposed project contains two parts: mapping the rat genome on the one hand and analysis of multifactorial traits on the other.
The mapping work will include:
- genetic linkage work of transcribed genes,especially "anchored reference loci" for comparative mapping, and of anonymous markers, using molecular methods that have already been implemented in the participating labs, and with rat strains and strain crosses already available, generation of new markers (e.g. AFLP, RAPD)
- chromosome and cytogenetic mapping of genes using cell hybrids and fluorescence in situ hybridization (FISH), including orientation of the linkage groups with respect to the chromosomes and amalgamation of the genetic linkage and the cytogenetic maps
- isolation of whole genome radiation hybrids to generate a high resolution map of active genes, even if they are devoid of genetic polymorphism - construction of new genomic DNA libraries
- ensuring availability of the generated data as well as those linkage data disseminated in the literature to the scientific community via expansion of the already implemented rat genome database and the rat encyclopedia which is being implemented.
The analysis of multifactorial traits will deal with cancer, neurological and psychiatric disorders, autoimmune diseases and the dissection of the rat MHC, metabolic studies, hypertension and morphogenesis. This work will be greatly facilitated by the collaborations established within the proposed project, and by the flow of new information among the groups.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information bases de données
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
30623 Hannover
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.