Objectif
Protein folding problem is one of the most challenging issues in biophysical sciences. During the past few years it was shown that some diseases are connected with protein misfolding and formation of insoluble aggregates called amyloid plaques. These processes may be associated with several diseases like Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Creutzfeldt-Jacob's disease and even certain forms of cancer.
The main objective of the present research project is to gain a deeper insight into the molecular mechanisms of protein folding and misfolding, and the mechanical properties of some correctly folded proteins (especially those rich in a-helices) and misfolded-like proteins (rich in ß-sheets), as well as into amyloid aggregation. This will be done using detailed atomistic and coarse-grained models, as well as experiment. We firmly believe that such combined experimental, theoretical and simulation study is the only route for understanding of molecular mechanisms of many diseases.
Main goals of present project are:
- Development of theories, models and simulation methods suitable to describe the protein folding, including folding of three-state proteins, and predict the experiment.
- Development of theory, models and simulation methods for description of mechanical unfolding of proteins consisting of different structural elements (rich in a-helices and rich in ß-sheets).
- Elaboration of theory of amyloid aggregation, and experimental examination of the main theoretical conclusions.
We propose to bring together five leading scientific groups: two experts in analytical theory, two experts in simulation and one experimental group. Theory and computer simulation of protein folding and misfolding will approach the protein folding through multi-scale molecular modelling while the experimental group will examine the main theoretical predictions. The key point of these investigations will be to use different resolutions: analytical theories and coarse-grained modelling to obtain basic information on molecular mechanisms of protein folding at a large scale, molecular dynamics (MD) simulations and experiment to obtain detailed information on structure and molecular mechanisms of protein folding.
The main scientific outcome of the proposed research will be important for the general understanding of the molecular mechanisms of protein folding, misfolding and amyloid aggregation leading to many diseases.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Données non disponibles
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Données non disponibles
Coordinateur
LEEDS
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.