Obiettivo
Protein folding problem is one of the most challenging issues in biophysical sciences. During the past few years it was shown that some diseases are connected with protein misfolding and formation of insoluble aggregates called amyloid plaques. These processes may be associated with several diseases like Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Creutzfeldt-Jacob's disease and even certain forms of cancer.
The main objective of the present research project is to gain a deeper insight into the molecular mechanisms of protein folding and misfolding, and the mechanical properties of some correctly folded proteins (especially those rich in a-helices) and misfolded-like proteins (rich in ß-sheets), as well as into amyloid aggregation. This will be done using detailed atomistic and coarse-grained models, as well as experiment. We firmly believe that such combined experimental, theoretical and simulation study is the only route for understanding of molecular mechanisms of many diseases.
Main goals of present project are:
- Development of theories, models and simulation methods suitable to describe the protein folding, including folding of three-state proteins, and predict the experiment.
- Development of theory, models and simulation methods for description of mechanical unfolding of proteins consisting of different structural elements (rich in a-helices and rich in ß-sheets).
- Elaboration of theory of amyloid aggregation, and experimental examination of the main theoretical conclusions.
We propose to bring together five leading scientific groups: two experts in analytical theory, two experts in simulation and one experimental group. Theory and computer simulation of protein folding and misfolding will approach the protein folding through multi-scale molecular modelling while the experimental group will examine the main theoretical predictions. The key point of these investigations will be to use different resolutions: analytical theories and coarse-grained modelling to obtain basic information on molecular mechanisms of protein folding at a large scale, molecular dynamics (MD) simulations and experiment to obtain detailed information on structure and molecular mechanisms of protein folding.
The main scientific outcome of the proposed research will be important for the general understanding of the molecular mechanisms of protein folding, misfolding and amyloid aggregation leading to many diseases.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Dati non disponibili
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Dati non disponibili
Coordinatore
LEEDS
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.