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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS
Contenu archivé le 2024-05-27

Exon trapping insert consortium

Objectif

A network of laboratories will be formed to create a large population of gene-trap insertions in the genome of Arabidopsis thaliana to detect the spatial and temporal expression patterns of approximately 5.000 genes, and to identify and characterise the regulatory elements of these genes. Data obtained on the genes, in which transposons are inserted, will be obtained by sequencing the insertion site and this will be related to genome sequence and expression patterns in a functional genomics database. Gene expression patterns in a wide range of tissues and conditions will be defined and put in the database. The products of research will be a powerful resource to analyse the function of 20% of the genes in Arabidopsis, and these will be exploited by industrial partners.
The EXOTIC project has generated 25,367 gene trap lines. This collection stands beside the CSHL collection of 18,764 gene trap and 14,204 enhancer trap lines (http://genetrap.cshl.org/servlet/CurrentStats(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)). These collections, when available via stock centres and comprehensively described, will be a key asset for understanding gene function and gene expression in Arabidopsis. Table 2 describes the current status of gene disruption in Arabidopsis. The AtIDB database shows that 80% of the 29,000 predicted genes harbour disruptions. This represents outstanding progress towards the community goal of generating disruptions of all genes by 2005. It also shows that EU activities (GABI-KAT, Flag, Garnet and EXOTIC) have contributed nearly half of the lines available for gene disruption. It is likely that the random insertion strategies used with such success so far will not be cost effective in reaching the remaining 20% of genes, so new approaches will be needed. Here transposon insertions, which can be re-mobilised for efficient local mutagenesis, may provide users with resources to tackle genes of interest. Gene traps can also identify gene disruptions in the heterozygous state and that are expressed in the extended haploid stages, which may affect zygote viability. These factors suggest gene trap collections, such as the EXOTIC collection, will provide a key resource for tackling the remaining genes.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

Données non disponibles

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

CSC - Cost-sharing contracts

Coordinateur

AMICA SCIENCE EEIG
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Adresse
Norwich Research Park John Innes Centre, Colney
NR4 7UH NORWICH
Royaume-Uni

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Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Participants (10)

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