Objetivo
The following studies have been carried out:
Analysis of the functional geometries of bacteriophage Mu transposase and repressor:
Site directed mutagenesis of the Mu A gene:
Non sense mutations were introduced in vitro by site directed mutagenesis in regions of the transposase gene, A, allowing a more precise mapping of one subdomain of the transposase (residues 426-501) located towards the C-terminal end of the protein and involved in pA binding to the ends of the Mu genome. It was also found to be likely that the tryptophan residue at position 32 was crucial for activity.
Characterization of repressor mutants:
The differences between transposase and repressor affinities for the internal activating sequence (IAS)/operator deoxyribonucleic acid (DNA) segment, were investigated by analysis of the functional geometry of Mu repressor. The N-terminal domain of repressor was not sufficient for operator binding. Mutations in the carboxy terminal domain of Mu repressor suggested a key role for this part of the protein.
Analysis of the N-terminal domains of Mu repressor and transposase:
Repressor and transposase binding to the operator/IAS sequence suggests that, despite their having different affinities for this DNA segment, both proteins have N-terminal domains which could share similar 3-dimensional structures. In order to determine this structure by nuclear magnetic resonance (NMR), peptides were derived from repressor and transposase which would still be active for binding to the operator/IAS sequence.
Oligomerization properties of Mu repressor:
Protein crosslinking experiments where the repressor was incubated at various concentrations with a protein crosslinking reagent and analysed by electrophoresis showed extensive intermolecular crosslinking.
IHF:
IHF and Mu repression;
the himA and himD genes of a phytopathogenic bacterium.
FIS:
role of FIS in the maintenance of bacteriophage Mu lysogeny by the repressor.
Gin-FIS:
analysis of protein protein interactions between Gin molecules during site specific recombination;
the FIS operon and its regulation;
cloning and characterization of E. coli genes regulated by FIS.
The structural and temporal architecture of protein/DNA complexes involved in two relatively well defined recombination reaction (phage Mu transposition ant the gin recombinational switch) will be investigated with particular emphasis on the role of host proteins in these processes. It is proposed to use both in vivo and in vitro approaches in these studies. The host factors include the histone-like proteins HU, IHF, and Fis (for which mutants and cloned genes are available) and an additional as yet unidentified DNA binding protein.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Datos no disponibles
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
BRUXELLES
Bélgica
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.