Description du projet DEENESFRITPL Focus sur les architectures d’amplificateurs: mécanismes de régulation transcriptionnelle Cartographier la quasi-totalité du génome humain a constitué un exploit monumental. Au cours des décennies qui ont suivi, les scientifiques ont continué à explorer la dynamique de l’expression génétique et des fonctions des protéines dans la santé et la maladie. Le projet SCORA, financé par le CER, se concentrera sur la dynamique du génome dans la réalisation des programmes d’expression génétique spécifiques en établissant le profil des éléments régulateurs, des portions d’ADN connues sous le nom de promoteurs de gènes (sites d’initiation de la transcription) et d’amplificateurs de transcription (qui amplifient la transcription au niveau des promoteurs de gènes). L’identification de ces éléments régulateurs et la détermination de leur activité et de leurs fonctions, seuls ou reliés au sein d’architectures régulatrices plus vastes, devraient permettre de mieux comprendre en quoi leur dérèglement est lié à la maladie. Afficher les objectifs du projet Masquer les objectifs du projet Objectif Enhancers control the correct spatio-temporal activation of gene expression. A comprehensive characterization of the properties and regulatory activities of enhancers as well as their target genes is therefore crucial to understand the regulation and dysregulation of differentiation, homeostasis and cell type specificity.Genome-wide chromatin assays have provided insight into the properties and complex architectures by which enhancers regulate genes, but the understanding of their mechanisms is fragmented and their regulatory targets are mostly unknown. Several factors may confound the inference and interpretation of regulatory enhancer activity. There are likely many kinds of regulatory architectures with distinct levels of output and flexibility. Despite this, most state-of-the-art genome-wide studies only consider a single model. In addition, chromatin-based analysis alone does not provide clear insight into function or activity.This project aims to systematically characterize enhancer architectures and delineate what determines their: (1) restricted spatio-temporal activity; (2) robustness to regulatory genetic variation; and (3) dynamic activities over time. My work has shown enhancer transcription to be the most accurate classifier of enhancer activity to date. This data permits unprecedented modeling of regulatory architectures via enhancer-promoter co-expression linking. Careful computational analysis of such data from appropriate experimental systems has a great potential for distinguishing the different modes of regulation and their functional impact.The outcomes have great potential for providing us with new insights into mechanisms of transcriptional regulation. The results will be particularly relevant to interpretation of regulatory genetic variations. Ultimately, knowing the characteristics and conformations of enhancer architectures will increase our ability to link variation in non-coding DNA to phenotypic outcomes like disease susceptibility. Champ scientifique natural sciencesbiological sciencesgeneticsDNAnatural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsnatural sciencesbiological sciencesgeneticsRNAnatural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomesnatural sciencesbiological sciencesgeneticsepigenetics Mots‑clés transcriptional regulation enhancers enhancer RNA Programme(s) H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC) Main Programme Thème(s) ERC-StG-2014 - ERC Starting Grant Appel à propositions ERC-2014-STG Voir d’autres projets de cet appel Régime de financement ERC-STG - Starting Grant Institution d’accueil KOBENHAVNS UNIVERSITET Contribution nette de l'UE € 1 249 225,00 Adresse NORREGADE 10 1165 Kobenhavn Danemark Voir sur la carte Région Danmark Hovedstaden Byen København Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Participation aux programmes de R&I de l'UE Opens in new window Réseau de collaboration HORIZON Opens in new window Coût total € 1 249 225,00 Bénéficiaires (4) Trier par ordre alphabétique Trier par contribution nette de l'UE Tout développer Tout réduire KOBENHAVNS UNIVERSITET Danemark Contribution nette de l'UE € 1 249 225,00 Adresse NORREGADE 10 1165 Kobenhavn Voir sur la carte Région Danmark Hovedstaden Byen København Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Participation aux programmes de R&I de l'UE Opens in new window Réseau de collaboration HORIZON Opens in new window Coût total € 1 249 225,00 THE UNIVERSITY OF BIRMINGHAM Royaume-Uni Contribution nette de l'UE € 103 590,00 Adresse Edgbaston B15 2TT Birmingham Voir sur la carte Région West Midlands (England) West Midlands Birmingham Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Participation aux programmes de R&I de l'UE Opens in new window Réseau de collaboration HORIZON Opens in new window Coût total € 103 590,00 ROYAL INSTITUTION FOR THE ADVANCEMENT OF LEARNING MCGILL UNIVERSITY Canada Contribution nette de l'UE € 60 352,50 Adresse 845 SHERBROOKE STREET WEST H3A0G4 Montreal Voir sur la carte Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Participation aux programmes de R&I de l'UE Opens in new window Réseau de collaboration HORIZON Opens in new window Coût total € 60 352,50 KLINIKUM DER UNIVERSITAET ZU KOELN Allemagne Contribution nette de l'UE € 23 125,00 Adresse Kerpener Strasse 62 50937 Koeln Voir sur la carte Région Nordrhein-Westfalen Köln Köln, Kreisfreie Stadt Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Participation aux programmes de R&I de l'UE Opens in new window Réseau de collaboration HORIZON Opens in new window Coût total € 23 125,00
