Une détection précoce de la néphropathie chronique
La néphropathie chronique conduit à une insuffisance rénale, les patients nécessitant une thérapie de remplacement rénal obligatoire, une transplantation ou une dialyse à vie. Plusieurs stratégies thérapeutiques existent pour le traitement de la néphropathie chronique, et la majorité implique l'inhibition du système de rénine/angiotensine ou des agents anti-inflammatoires. Le traitement à un âge précoce pourrait permettre de guérir la maladie, mais le traitement à un stade ultérieur ne peut que retarder la progression de la maladie, soulignant le besoin évident d'une détection précoce. L'objectif du projet PROTOCLIN (Improvement of tools and portability of mass spectrometry-based clinical proteomics as applied to chronic kidney disease) consistait à faire progresser l'électrophorèse associée à la technologie de spectrométrie de masse (CE-MS) pour découvrir des biomarqueurs de la néphropathie. Pour assurer la portabilité, une plateforme CE-MS a été établie dans un laboratoire partenaire. Étant donné que cette approche multidimensionnelle commandait la comparabilité des ensembles de données, les solutions logicielles ont permis l'échange et la comparaison des données obtenues à partir des différents instruments conçus. Les premiers essais de validation ont confirmé la portabilité et la précision de la plateforme et du logiciel. Une évaluation plus poussée de la plateforme CE-MS a été effectuée en comparaison à la chromatographie liquide (LC-MS) à l'aide d'échantillons d'urine standard. L'analyse a clairement montré que CE-MS présente une reproductibilité plus élevée, attribuée à la calibration du temps de migration des peptides et à l'élimination des effets de contamination. Tous les partenaires ont coordonné la formation dans toutes les plateformes MS disponibles. Des protocoles et procédures standard de traitement de l'urine ont été établis dans tous les laboratoires. La plateforme CE-MS a été caractérisée au niveau de ses performances analytiques afin de poser les bases nécessaires à la comparaison entre les sites. Un problème très pertinent lié à l'analyse des biomarqueurs dans l'urine est l'analyse quantitative et comparative, qui nécessite la normalisation des données. Pour satisfaire ces exigences, les partenaires ont mis au point un logiciel de normalisation et de quantification des signaux CE-MS par rapport aux normes internes. Les membres du projet ont démontré que les biomarqueurs protéomiques d'urine peuvent fournir des informations cliniques pour la détection précoce et le diagnostic différentiel de la néphropathie en évitant les procédures invasives. Ceci met en évidence la nécessité d'appliquer des biomarqueurs protéomiques urinaires de la néphropathie sous la forme d'un criblage haut débit.
Mots‑clés
Néphropathie chronique, détection précoce, PROTOCLIN, spectrométrie de masse, biomarqueurs protéomiques
