De nouvelles cellules effectrices pour les champignons pathogènes
Les maladies fongiques ont de lourdes conséquences pour l'agriculture et la santé humaine. Chaque année, la pyriculariose du riz dévaste des récoltes qui auraient pu nourrir 60 millions de personnes. Certaines mycoses qui touchent l'homme en revanche, comme Candida, peuvent être fatales aux patients immunodéprimés. Pour faire avancer la recherche sur les nouveaux traitements antimycosiques, l'UE a financé le projet ARIADNE(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) (Signaling circuitry controlling fungal virulence: identification and characterization of conserved and specific fungal virulence genes as common antifungal targets) qui a permis de rassembler un volume important de données sur la dynamique moléculaire de la pathogenèse mycosique et la transduction des signaux. Les chercheurs se sont concentrés sur les principales cascades de signalisation qui ont été conservées au fil de l'évolution par tous les pathogènes fongiques et jouent un rôle majeur dans l'infection. ARIADNE s'est constitué une base de données volumineuse regroupant le génome, le transcriptome et le protéome des principaux champignons pathogènes. L'on y retrouve notamment certains pathogènes humains tristement célèbres, comme Aspergillus fumigatus et Candida albicans, mais aussi certains pathogènes végétaux, tels que le fléau des cultures Fusarium oxysporum ou Magnaporthe grisea qui ravage les rizières. L'analyse des données a fourni des résultats probants quant à la pathogenèse des champignons. L'étude des voies métaboliques propres à la protéine MAPK a permis aux chercheurs d'isoler de nouveaux gènes cibles, éléments essentiels à la morphogenèse de l'infection et à sa virulence. L'importance de la signalisation de la protéine MAPK dans la sensibilité chimiotrophe de son hôte Fusarium a également été révélée. Les plantes disposent de leur propre arsenal pour lutter contre l'infection, mais il est souvent mis à mal par les champignons. Un ensemble résistant aux enzymes de dégradation des parois cellulaires (EDPC) en présence d'un pH 5 a pu être identifié. Les EDPC permettent au champignon de percer la paroi cellulaire pour pénétrer la cellule. M. grisea (pyriculariose du riz) a révélé des protéines effectrices contribuant à l'annulation de l'immunité de la plante. Les champignons pathogènes disposent de mécanismes complexes pour infecter leur hôte. Les chercheurs ont mis au point un nouveau modèle d'infection des invertébrés par F. oxysporum, un parasite multi-hôtes qui s'attaque aux végétaux, mais qui peut aussi parfois devenir un pathogène humain fatal pour les patients immunodéprimés. Par ailleurs, un nouvel outil pour l'étude des effets pharmacologiques des inhibiteurs a été élaboré sur la base de macrophages murins présentant des cellules de F. oxysporum phagocytées (ingérées). La collaboration entre les industriels et les instituts spécialisés dans les effets pathogènes des champignons contribuera au développement de nouveaux traitements contre les mycoses sur la base des résultats des recherches menées dans le cadre du projet ARIADNE. Le projet a également permis de former une nouvelle génération de chercheurs pluridisciplinaires, qui disposent déjà d'une longue expérience du transfert des connaissances entre les secteurs universitaires et industriels. Ils ont ainsi adopté une approche à la fois scientifique et commerciale.
Mots‑clés
Champignons pathogènes, virulence, agriculture, santé humaine, cascades de signalisation, immunité des plantes
