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Nuevo recurso del EMBL para biocientíficos

El Laboratorio Europeo de Biología Molecular (LEBO) acaba de publicar el recurso en línea gratuito, CiteXplore, que conecta la literatura científica con una serie de bases de datos biológicas. Hace tiempo que las biociencias necesitan una herramienta capaz de integrar los ar...

El Laboratorio Europeo de Biología Molecular (LEBO) acaba de publicar el recurso en línea gratuito, CiteXplore, que conecta la literatura científica con una serie de bases de datos biológicas. Hace tiempo que las biociencias necesitan una herramienta capaz de integrar los artículos de las revistas científicas con las bases de datos biológicas sobre el ADN y las secuencias de proteínas, funciones y estructuras moleculares y micromatrices («microarray»), según afirman los responsables del desarrollo de CiteXplore. «Si está leyendo un resumen descriptivo de un determinado gen o proteína, lo lógico es que desee más información, sobre su secuencia o función, por ejemplo, y acceso al documento íntegro», explica Peter Stoehr, coordinador de CiteXplore. CiteXplore, desarrollado por el Instituto Europeo de Bioinformática del LEBO, recoge, relacionándolos con los artículos completos, un gran número de resúmenes procedentes de un amplio abanico de bases de datos de textos, tales como la Oficina Europea de Patentes, la base de datos MEDLINE de la Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos y la Academia de Ciencias china. La potente herramienta de extracción de textos es la encargada de localizar los términos biológicos y enlazarlos directamente con la entrada correspondiente en las extensas bases de datos biológicos del EBI: la Base de datos de secuencias de nucleótidos del LEBO, que contiene secuencias de ADN y ARN; UniProt, con información sobre estructuras y funciones de proteínas, y ArrayExpress, que recoge información de expresión génica. Los responsables de CiteXplore tienen previsto ampliar la cobertura informativa a las ciencias vegetales, agrícolas y alimentarias, y relacionar la iniciativa con el reciente proyecto británico PubMedCentral. EBI es la mayor herramienta europea de divulgación de información biológica. Ocupa un lugar destacado en la Hoja de Ruta que ha publicado hace poco el Forum estratégico europeo para las infraestructuras de investigación.

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