Nouvelle ressource du LEBM pour les chercheurs dans les biosciences
Le Laboratoire européen de biologie moléculaire (LEBM) a lancé une ressource en ligne gratuite appelée CiteXplore, qui relie la littérature scientifique à des bases de données biologiques. Les sciences biologiques avaient besoin depuis longtemps d'un outil qui associe les articles de magazines scientifiques à des bases de données contenant des informations biologiques, telles que des séquences d'ADN et de protéines, des fonctions et structures de molécules, ainsi que des données sur les microréseaux, d'après les concepteurs de CiteXplore. «Lorsque vous lisez un résumé décrivant un gène ou une protéine spécifique, vous souhaitez généralement de plus amples informations à ce sujet, par exemple sa séquence ou sa fonction, ainsi qu'un accès facile à l'intégralité de l'article», a expliqué Peter Stoehr, qui coordonne CiteXplore. Élaboré par l'Institut européen de bioinformatique (EBI) du LEBM, CiteXplore réunit les résumés d'articles issus d'une série de bases de données de la littérature, notamment l'Office européen des brevets, la base de données MEDLINE de la bibliothèque nationale de médecine des États-Unis et l'Académie chinoise des sciences, puis crée un lien de ces résumés vers les articles dans leur intégralité. Un puissant outil d'exploration de texte identifie les termes biologiques dans le document et les rattache directement à l'entrée pertinente dans les riches bases de données biologiques de l'EBI, parmi lesquelles figurent la base de données sur les séquences de nucléotides du LEBM, qui inclut les séquences d'ADN et d'ARN, UniProt, qui contient des informations sur les structures et les fonctions protéiniques, et ArrayExpress, qui renferme des informations sur le mode d'expression des gènes. CiteXplore a l'intention d'élargir la gamme des ressources qu'il couvre dans la littérature afin d'accueillir des domaines tels que la botanique, l'agriculture et les sciences alimentaires et de l'intégrer au projet PubMedCentral, qui a été lancé récemment au Royaume-Uni. Plus grande source de diffusion d'informations biologiques en Europe, l'EBI a récemment été mis à l'honneur dans la feuille de route du Forum stratégique européen sur les infrastructures de recherche.
Pays
Allemagne