EMBL richtet neue Informationsquelle für Biowissenschaftler ein
Das Europäische Laboratorium für Molekularbiologie (EMBL) hat eine kostenlose Online-Informationsquelle mit dem Namen CiteXplore eingerichtet, die wissenschaftliche Literatur mit Biologiedatenbanken verbindet. Laut den Entwicklern von CiteXplore besteht in den Biowissenschaften seit langem Bedarf an einem Tool, das Artikel aus wissenschaftlichen Zeitschriften mit Datenbanken verbindet, die biologische Informationen wie DNS und Proteinsequenzen, Molekülfunktionen und -strukturen und Microarraydaten enthalten. "Bei der Lektüre eines Abstracts über ein bestimmtes Gen oder Protein möchte man im Allgemeinen mehr Informationen bekommen, beispielsweise zur Sequenz oder Funktion, sowie einfachen Zugang zum vollständigen Artikel", erläuterte Peter Stoehr, CiteXplore-Koordinator. CiteXplore wurde vom Europäischen Institut für Bioinformatik (EBI) des EMBL entwickelt und umfasst Abstracts aus einer Reihe von Literaturdatenbanken, einschließlich des Europäischen Patentamts, der MEDLINE-Datenbank der US National Library of Medicine und der Chinesischen Akademie der Wissenschaften. Über einen Link kann man die vollständigen Artikel des jeweiligen Abstracts aufrufen. Mit einem modernen Text-Mining-Tool werden biologische Begriffe im Text bestimmt und direkt mit dem relevanten Eintrag in den umfassenden Biologiedatenbanken des EBI verbunden. Zu diesen Datenbanken gehören die EMBL-Nukleotidsequenzdatenbank, die DNS- und RNS-Sequenzen umfasst, UniProt, die Informationen zu Proteinstruktur und -funktion enthält, sowie ArrayExpress mit Informationen zur Genexpression. CiteXplore beabsichtigt, künftig eine größere Bandbreite an Literaturquellen abzudecken, um auch Fachbereiche wie z. B. Pflanzenwissenschaft, Landwirtschaft und Ernährungswissenschaften zu umfassen, und sie mit dem britischen Projekt PubMedCentral zu integrieren, das kürzlich eingerichtet wurde. Das EBI, das unlängst vom Europäischen Strategieforum für Forschungsinfrastrukturen in seiner Roadmap hervorgehoben wurde, ist europaweit der größte Multiplikator von biowissenschaftlichen Informationen.
Länder
Deutschland