Libérer le potentiel biotechnologique inexploité de la mer
Alors que les micro-organismes marins ont longtemps été identifiés comme une potentielle ressource biotechnologique inexploitée, leur exploitation a été longtemps freinée par la difficulté et le coût liés à l'isolation de leurs nouveaux produits chimiques et précieuses molécules. Une grande majorité de micro-organismes marins n'a donc jusqu'à présent pas été correctement cultivée. Il s'agit d'une occasion manquée que le projet MaCuMBA («Marine Microorganisms: Cultivation Methods for improving their Biotechnological Applications») financé par l'UE souhaite rattraper. Lancée en août 2012, cette initiative de quatre ans permettra d'améliorer le taux d'isolation des micro-organismes marins à l'aide de méthodes innovantes. Parmi les méthodes utilisées, citons la co-culture de micro-organismes interdépendants imitant l'environnement naturel. La signalisation des molécules produites par les micro-organismes permettra de stimuler la croissance de mêmes espèces ou d'espèces différentes. En effet, ces molécules de signalisation représentent elles-mêmes un produit intéressant et potentiellement commercialisable. Le consortium du projet a saisi l'occasion de faire le bilan des progrès accomplis lors de sa première assemblée générale qui a eu lieu en septembre à Rostock, en Allemagne. «Les travaux effectués par le projet MaCuMBA augmenteront le temps et les efforts investis dans l'obtention de nouveaux microbes en culture pure», explique le professeur Francisco Rodriguez-Valera, responsable du lot de travaux 6 de MaCuMBA sur le séquençage, les banques génomiques et métagénomiques et les analyses métagénomiques. «Ce type de recherche est limité par le risque élevé qu'il implique, et ce en dépit de l'énorme avantage qu'il fournit lorsque de nouveaux microbes significatifs sont obtenus en cultures pures. Des projets tels que MaCuMBA sont importants». Le lot de travaux 6 s'appuie sur la génomique et la métagénomique pour obtenir des cultures pures de microbes marins individuels et améliorer notre compréhension de leur biologie. «Le séquençage des acides nucléiques est la méthode actuellement la plus rapide et au taux le plus élevé pour acquérir des informations sur les microbes», explique le professeur Rodriguez-Valera. «Nous utiliserons ces technologies pour faire progresser nos connaissances sur les principales caractéristiques microbiennes jouant un rôle dans les fonctions de l'écosystème de l'océan. Apprendre à utiliser ces organismes nous aidera à améliorer la viabilité de l'écosystème marin et de l'économie européenne grâce à des procédés biotechnologiques». Globalement, le projet permettra d'augmenter les taux de réussite dans l'isolation des microbes marins et de nombreuses nouvelles bactéries marines, d'améliorer l'efficacité de la culture des micro-organismes marins importants et d'accroître le taux de production de nouvelles biomolécules à forte valeur ajoutée. MaCuMBA vise également à développer des méthodes de culture imitant les conditions naturelles et à faire progresser notre compréhension de la façon dont la communication de cellule à cellule pourrait influencer l'efficacité de l'isolation et de la culture des micro-organismes marins. Le projet MaCuMBA est dirigé par le Royal Netherlands Institute for Sea Research (NIOZ) et est une coentreprise de 23 institutions partenaires de 11 pays de l'UE. Tous les partenaires partagent l'objectif commun de découvrir la diversité incalculable de microbes marins grâce à des stratégies dépendant des cultures. Le projet devrait se poursuivre jusqu'en juillet 2016.Pour plus d'informations, veuillez consulter: Projet MACUMBA: http://www.macumbaproject.eu/ Fiche d'informations du projet:
Pays
Pays-Bas