Les écosystèmes marins en point de mire
Le projet BASICS financé par la CE a mis l'accent sur l'identification des microorganismes associés au cycle du carbone et du soufre. Il s'agit là d'un aspect important de l'étude de la diversité marine en général, qui devrait mettre en lumière les liens entre la diversité et le rôle des bactéries marines dans l'écosystème. L'institut de microbiologie marine Max-Planck a développé une nouvelle technique d'identification des bactéries marines dans le cadre du projet BASICS. La technologie à la base de cette nouvelle approche, appelée FISH (fluorescence in situ hybridization, hybridation in situ par fluorescence), fait appel à des sondes d'oligonucléotides dirigées contre le rARN, lesquelles sont en mesure de choisir sélectivement différentes bactéries d'échantillons marins et sédimentaires. L'intensité de la fluorescence est à chaque fois directement associée à l'abondance de la population bactérienne visée dans l'échantillon. L'utilisation de cette méthode permet donc d'identifier rapidement la population bactérienne. Son approche standardisée offre en outre un point de référence commun à l'ensemble des partenaires du projet.
